Pracownia Bioinformatyczna Instytutu Genetyki Człowieka PAN prowadzi badania i zapewnia wsparcie w zakresie biologii obliczeniowej dla grup badawczych w ramach Instytutu, rozwija własne projekty badawcze oraz świadczy usługi dla podmiotów zewnętrznych w kraju i za granicą. Nasze wsparcie obejmuje przede wszystkim:
- analizy danych wysokoprzepustowych (RNA-seq, RIP-Seq, CLIP-Seq itd.)
- analizy danych z sekwencjonowania ONT nanopore
- analizy danych proteomicznych/metabolomicznych
- integrację danych
- tworzenie obliczeniowych ścieżek analiz (Snakemake)
- tworzenie narzędzi naukowych i baz danych opartych o rozwiązania webowe (stosujemy model technologiczny oparty o Django)
- analizy statystyczne i graficzne reprezentacje danych
- tworzenie modeli uczenia maszynowego (ML)
- inne analizy bioinformatyczne dostosowane do potrzeb
W naszych badaniach skupiamy się w szczególności na biologii obliczeniowej RNA, włączając w to struktury i funkcje cząsteczek RNA, modyfikacje, białka wiążące się do RNA oraz potranskrypcyjną regulację genów.
Publikacje na temat efektów naszych prac mogą Państwo znaleźć na stronach:
https://orcid.org/0000-0002-4115-4191,
https://orcid.org/0000-0002-7387-8194.
Nasze kompetencje i szerokie doświadczenie w obszarze bioinformatyki zdobyliśmy realizując zadania w uznanych instytucjach naukowych (HHMI Laboratory of RNA Molecular Biology, The Rockefeller University; RNA Bioscience Initiative, University of Colorado School of Medicine), a także dzięki współpracy z firmami wytwarzającymi oprogramowanie i najlepszymi firmami szkoleniowym w kraju jak i za granicą. Współpracujemy z instytucjami naukowymi zarówno tu w Poznaniu, na terenie kraju, jak i na całym świecie (University of Colorado, Vanderbilt University, University Medical Center Groningen).
Jeśli zajmujesz się interesującym zagadnieniem naukowym i potrzebujesz naszego wsparcia, profesjonalnego doradztwa lub współpracy w zakresie biologii obliczeniowej – koniecznie skontaktuj się z nami: marcin.sajek@igcz.poznan.pl, tomasz.wozniak@igcz.poznan.pl
Oferujemy rozwiązania dostosowane do indywidualnych potrzeb, realizowane przy użyciu zaawansowanych technologii bioinformatycznych i programistycznych, kompleksowo adresujące zgłaszane przez zamawiającego zagadnienia i przedmiot analiz. Wieloaspektowe spojrzenie i nieszablonowość rozwiązań jest tym, co nas wyróżnia spośród wielu jednostek naukowych świadczących podobne usługi. Pozwala to zamawiającemu oczekiwać rozwiązań dostosowanych typowo do jego wymagań, uwzględniających potrzeby i okoliczności danego przypadku.