- Plan wykładu „Biologia systemowa” – semestr letni 2023/2024 (wykład fakultatywny)
- SYLLABUS „Biologia systemowa” – semestr letni 2023/2024
BIOLOGIA SYSTEMOWA
Semestr letni 2023/2024
(wykład fakultatywny)
Wykłady będą odbywały się zgodnie z poniższym planem wyłącznie on-line.
Osoba odpowiedzialna: prof. dr hab. Jadwiga Jaruzelska.
Data | Temat |
6 marzec 11:45-13:15 |
1. Wprowadzenie do języka R (biblioteka dplyr)
2. Podstawy wizualizacji danych: wykres rozrzutu, wykres pudełkowe oraz histogram (biblioteka ggplot2) Dr hab. Tomasz Górecki, prof. UAM |
6 marzec 13:30-15:00 |
1. Statystyki opisowe: średnia, mediana, dominanta, wariancja, odchylenie standardowe, błąd standardowy
2. Testy statystyczne – wprowadzenie Dr hab. Tomasz Górecki, prof. UAM |
20 marzec
15:00-16:30 |
Wprowadzenie do biologii systemowej
dr Marcin Sajek |
13 marzec 10:00 – 11:30 |
1. Testy zgodności: test dokładny, test chi2 oraz test G2. Porównywanie średnich w dwóch populacjach – test t dla prób niezależnych i zależnych. Test Wilcoxona
Dr hab. Tomasz Górecki, prof. UAM |
13 marzec 11:45 – 13:15 |
1. Założenia w testach parametrycznych: normalność, homoskedastyczność wariancji – przekształcenia zmiennych (metoda Boxa-Coxa)
2. Porównanie wielu prób – jedno i dwuczynnikowa analiza wariancji (ANOVA). Test Kruskala-Wallisa oraz test Friedmana. Porównania wielokrotne (post-hoc) Dr hab. Tomasz Górecki, prof. UAM |
13 marzec 13:30 – 15:00 |
Testy niezależności. Wykres mozaikowy, balonowy oraz wykres skojarzeńDr hab. Tomasz Górecki, prof. UAM |
3 kwietnia 10:00 -11:30 |
Współczynnik korelacji Pearsona i Spearmana. Zastosowanie wykresu rozrzutu oraz wykresu słonecznikowego do analizy korelacjiDr hab. Tomasz Górecki, prof. UAM |
3 kwietnia 11:45 -13:15 |
Regresja prosta. Regresja wielokrotnaDr hab. Tomasz Górecki, prof. UAM |
3 kwietnia 13:30 -15:00 |
BioconductoRDr hab. Tomasz Górecki, prof. UAM |
BIOLOGIA SYSTEMOWA
Semestr letni 2023/2024
(Wykłady będą odbywały się w środy w sali seminaryjnej IGC PAN)
Nazwa przedmiotu | Biologia systemowa |
Miejsce | Instytut Genetyki Człowieka Polska Akademia Nauk ul. Strzeszyńska 32 |
Język przedmiotu | angielski |
Efekty kształcenia dla przedmiotu ujęte w kategoriach: wiedzy, umiejętności oraz kompetencji społecznych | Doktorant zdobywa wiedzę na temat metod statystycznych stosowanych w naukach biologicznych. Wykłady będą poświęcone w szczególności następującym zagadnieniom:
|
Typ przedmiotu | fakultatywny |
Semestr/rok | Semestr letni 2023/2024 |
Imię i nazwisko osoby/osób prowadzącej/prowadzących przedmiot | dr hab. Tomasz Górecki, prof. UAM |
Imię i nazwisko osoby/osób egzaminującej/egzaminujących bądź udzielającej zaliczenia, w przypadku gdy nie jest to osoba prowadząca dany przedmiot | dr hab. Tomasz Górecki, prof. UAM |
Sposób realizacji | Wykład będzie prowadzony w języku angielskim z użyciem środków audiowizualnych |
Wymagania wstępne i dodatkowe | Znajomość języka angielskiego |
Liczba punktów ECTS | 2 ECTS |
Bilans punktów ECTS | Jeden punkt ECTS odpowiada efektom kształcenia, których uzyskanie wymaga od studenta średnio 25-30 godzin pracy, przy czym liczba godzin pracy studenta obejmuje zajęcia organizowane w ramach studiów. |
Stosowane metody dydaktyczne | Wykład na podstawie prezentacji przygotowanej w programie power point oraz rzutnika multimedialnego |
Metody sprawdzania i oceny efektów kształcenia uzyskanych przez doktorantów | egzamin ustny |
Forma i warunki zaliczenia przedmiotu | Pozytywna ocena egzaminu |
Treść przedmiotu |
|
Materiały dodatkowe | Prezentacja każdego wykładu w formacie PDF oraz skrypty z przykładami w języku R |
Bibliografia |
|