Prowadzone przez nas badania koncentrują się wokół genetyki nowotworów oraz genetyki zmysłów. Wykorzystujemy szereg technik biologii molekularnej i cytogenetyki (mikromacierze, NGS, pirosekwencjonowanie, FISH, FICTION) uzupełnionych o analizy funkcjonalne. Celem dociekań jest identyfikacja uszkodzeń w obrębie genomu i epigenomu przyczyniających się do rozwoju chorób nowotworowych lub chorób narządów zmysłów. Badania prowadzimy w ścisłej współpracy z renomowanymi zespołami w kraju i za granicą.
Zakład Genetyki Nowotworów
Wybrane publikacje
Robot-assisted cochlear implantation via a modified pericanal approach (artykuł dwujęzyczny)
Gawęcki W, Balcerowiak A, Podlawska P, Szyfter W, Wierzbicka M
Otolaryngol Pol, 2023; 77 (6): 18-23; doi: 10.5604/01.3001.0016.3414 doi: 10.5604/01.3001.0053.4090IF-0.6 MNiSW-140
Transcriptional reprogramming by mutated IRF4 in lymphoma.
Schleussner N, Cauchy P, Franke V, Giefing M, Fornes O, Vankadari N, Assi SA, Costanza M, Weniger MA, Akalin A, Anagnostopoulos I, Bukur T, Casarotto MG, Damm F, Daumke O, Edginton-White B, Gebhardt JCM, Grau M, Grunwald S, Hansmann ML, Hartmann S, Huber L, Kärgel E, Lusatis S, Noerenberg D, Obier N, Pannicke U, Fischer A, Reisser A, Rosenwald A, Schwarz K, Sundararaj S, Weilemann A, Winkler W, Xu W, Lenz G, Rajewsky K, Wasserman WW, Cockerill PN, Scheidereit C, Siebert R, Küppers R, Grosschedl R, Janz M, Bonifer C, Mathas S
Nature Commun, 2023 Nov 7; 14 (1): 6 947. doi: 10.1038/s41467-023-41954-8.IF-16.6 MNiSW-200
The difficult “childhood era” of the liquid biopsy as a diagnostic method in head and neck cancer patients.
Wierzbicka M, Bartochowska M
Otolaryng Pol, 2023, 77 (5) 43046, doi 10.5604/01.3001.0053.7550IF-0.6 MNiSW-100
CRISPR/Cas9 screen for genome-wide interrogation of essential MYC-bound E-boxes in cancer cells.
Kazimierska M, Podralska M, Żurawek M, Woźniak T, Kasprzyk ME, Sura W, Łosiewski W, Ziółkowska-Suchanek I, Kluiver J, van den Berg A, Rozwadowska N, Dzikiewicz-Krawczyk A
Molec Oncol, Epub 2023 Nov, 17 (11): 2295-2213, doi: 10.1002/1878-0261.13493, Epub Aug 7IF-6.6 MNiSW-140
Irreversible facial nerve palsy as a revelator of parotid gland cancer. Trwałe porażenie nerwu twarzowego jako rewelator raka ślinianki przyusznej (artykuł dwujęzyczny).
Marszał J, Bartochowska A, Klimza H, Nogal P, Wierzbicka M
Otolaryngol Pol, 2023; 77 (5): 8-13; DOI: 10.5604/01.3001.0053.4090IF-0.6 MNiSW-100
Difficult glottis - diagnostic dilemma in view of the clinical presentation.
Klimza H, Witkiewicz J, Jackowska J, Wierzbicka M
Otolaryngol Pol, 2023; 77 (4): 53-57, doi 10.5604/01.3001.0053.7263IF-0,6 MNiSW-100
Very late disease relapse in patient with B-common acute lymphoblastic leukemia treated with allogeneic stem cell transplantation: does clonal evolution play a role? Short communication.
Płotka A, Przybyłowicz-Chalecka A, Korolczuk M, Kanduła Z, Kiernicka-Parulska J A, Mierzwa, Jarmuż-Szymczak M, Gil L, Lewandowski K
Acta Haematol Pol, 2023; 54 (3):187-190. DOI: 10.5603/AHP.a2023.0009MNiSW-100
Sequence Variants Contributing to Dysregulated Inflammatory Responses Across Keratoconic Cone Surface in Adolescent Patients with Keratoconus.
Jaśkiewicz K, Maleszka-Kurpiel M, Kabza M, Karolak J, Gajęcka M.
Frontiers Immunol, 2023 June 6, 14:1197054, doi: 10.3389/fimmu.2023.1197054IF-7,3 MNiSW-140
BCR::ABL1-like acute lymphoblastic leukaemia: a single institution experience on identification of potentially therapeutic targetable cases
Płotka A, Przybyłowicz-Chalecka A, Korolczuk M, Kanduła Z, Ratajczak B, Kiernicka-Parulska J, Mierzwa A, Godziewska K, Jarmuż-Szymczak M, Gil L, Lewandowski K.
Molec Cytogenet. 2023 Jul 3;16 (1):14 10 stron, doi: 10.1186/s13039-023-00645-1.IF-1.3 MNiSW-70
The presence of additional cytogenetic aberrations in chronic myeloid leukemia cells at the time of diagnosis or their appearance on tyrosine kinase inhibitor therapy predicts the imatinib treatment failure
Ratajczak B, Przybyłowicz-Chałecka A, Czerwińska-Robak J, Kanduła Z, Ustaszewski A, Gil L, Lewandowski K, Jarmuż-Szymczak M.
Leuk Res, 2023;132 (Sept):107349. doi: 10.1016/j.leukres.2023.107349, Epub June 28.IF-2,7 MNiSW-70
Pozostałe publikacje
Wybrane projekty badawcze
1. Projekt badawczy PRELUDIUM – 21
„Metylom warstw i regionów topograficznych rogówki w stożku rogówki, badany z wykorzystaniem sekwencjonowania całego genomu”
Kierownik projektu: mgr Katarzyna Jaśkiewicz
Okres realizacji: 2023-2026
2. Projekt badawczy OPUS-21
„Uszkodzenia genu BCOR a aktywacja onkogennego szlaku CXCL12 w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2022-2025
3. Projekt badawczy OPUS – 21
„Dostępność chromatyny oraz warianty sekwencji w elementach regulatorowych w badaniach całogenomowych w patogenezie stożka rogówki”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marzena Gajęcka
Okres realizacji: 2022-2025
4. Projekt badawczy SONATA - 17
„Analiza metylomu cfDNA pacjentów z chłoniakiem Hodgkina”
Kierownik projektu: dr Kinga Bednarek
Okres realizacji: 2022-2025
5. Projekt badawczy OPUS-20
„Analiza funkcjonalna nowych, potencjalnie onkogennych miRNA w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2021-2024
6. Projekt badawczy PRELUDIUM - 19
„Mutacje elementów cis-regulatorowych jako potencjalny mechanizm prowadzący do niedostępności chromatyny i wyciszania genów w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: mgr Adam Ustaszewski
Okres realizacji: 2021-2024
7. Projekt badawczy OPUS – 16
„Wielopoziomowe badanie molekularne na podstawie laserowej mikrodysekcji rogówek w celu identyfikacji biomarkerów i celów terapeutycznych w stożku rogówki”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marzena Gajęcka
Okres realizacji: 2019-2024
8. Projekt ze środków Unii Europejskiej - Horyzont 2020
„On the road to excellence in unravelling the (epi)genetic landscape of hematologic neoplasms – NEXT_LEVEL”
Koordynator projektu ze strony IGC PAN: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2021-2023
9. Projekt badawczy PRELUDIUM - 18
„Rola metylacji DNA w etiologii wysokiej krótkowzroczności u polskich dzieci”
Kierownik projektu: dr Joanna Świerkowska
Okres realizacji: 2020-2023
Współpraca krajowa i zagraniczna
Katedra Otolaryngologii Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Genetyki i Mikrobiologii Farmaceutycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Chemii Nieorganicznej i Analitycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Klinika Hematologii i Transplantacji Szpiku Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Institute of Human Genetics, Christian Albrecht’s University, Kiel, Germany
Division of Hematology, Oncology and Tumor Immunology, Medical Department, Charité, Berlin, Germany
Institute of Cell Biology (Tumor Research), University Duisburg-Essen, Germany
Senckenberg Institute of Pathology, Goethe University Frankfurt, Germany
Department of Otorhinolaryngology – Head and Neck Surgery, University of Turku, Finland
Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine Houston, TX, USA
Nagrody i wyróżnienia
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska
Nagrodę Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka
Nagrodę Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka
Przyznał: PTGC
Podczas XI Zjazdu Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka w Bydgoszczy, dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska otrzymała Nagrodę Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka – stopień doktora nadany w latach 2018-2020. Tytuł nagrodzonej pracy doktorskiej: „Charakterystyka wybranych aspektów (epi)–genetycznych w wysokiej krótkowzroczności u polskich pacjentów”.
Kto:
mgr inż. Ewelina Kowal-Wiśniewska
Nagroda im. prof. Aleksandra Szczygła za pracę naukowo-badawczą opublikowaną w roku 2021
Przyznał: Polskie Towarzystwo Nauk Żywieniowych
za pracę naukowo-badawczą opublikowaną w roku 2021 z zakresu nauki o żywieniu człowieka: Alteration of the Early Development Environment by Maternal Diet and the Occurrence of Autistic-like Phenotypes in Rat Offspring.
Kto:
dr n. med. Julia Paczkowska
Dr Julia Paczkowska – została laureatką nagrody IX Edycji Konkursu Oddziału Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu
Przyznał: Oddział PAN w Poznaniu
za najlepszą publikację badawczą, która ukazała się w 2020 roku, a wiodącym autorem był doktorant.
Kto:
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr hab. n. med. i n. o zdr. Katarzyna Kiwerska
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr hab. n. med. i n. o zdr. Katarzyna Kiwerska
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Nagroda Wydziału Nauk Medycznych PAN
Przyznał: Wydział Nauk Medycznych PAN
Za cykl 5 prac dotyczących utraty genów supresji nowotworowej w płaskonabłonkowym raku krtani.
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska
Stypendium EMBO
Stypendium EMBO
Przyznał: Europejska Organizacji Biologii Molekularnej
Joanna Świerkowska z Zakładu Genetyki Nowotworów zdobyła stypendium Europejskiej Organizacji Biologii Molekularnej na realizacje projektu pt. „The role of the noncoding miRNA and enhancers in high myopia”. Badania w ramach grantu będą realizowane w Erasmus Medical Center, Holandia.
Kto:
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Stypendium
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej
Na realizację projekt pt “Platelets and platelet microparticles (PMP) as omnipresent RNA messengers in inflammatory diseases”.
Kto:
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
Powołanie na członka Rady Naukowej Instytutu Genetyki Człowieka PAN w Poznaniu na kadencję 2019-2022.
Przyznał: Rada Naukowa Instytutu Genetyki Człowieka PAN
Kto:
prof. dr hab. n. med. Marzena Gajęcka
Stypendium Fundacji Kościuszkowskiej
Przyznał: Fundacja Kościuszkowska
stypendium wyjazdowo-pobytowe z Fundacji Kościuszkowskiej, na rok akademicki 2019/2020, celem odbycia stażu naukowego w Baylor College of Medicine oraz Texas Children’s Hospital, w Houston, TX, w Stanach Zjednoczonych. Fundacja Kościuszkowska promuje polsko-amerykańską współpracę poprzez wymianę międzynarodową w dziedzinach edukacji, nauki oraz kultury. Fundacja Kościuszkowska przyznaje corocznie stypendia wyjazdowo-pobytowe oraz granty dla Polaków na studia, badania naukowe i/lub dydaktykę w uniwersytetach lub innych instytucjach realizujących kształcenie wyższe w Stanach Zjednoczonych.
Kto:
mgr Adam Ustaszewski
Mgr Adam Ustaszewski otrzymał stypendium międzynarodowe (Short-Term Fellowship) przyznane przez Europejską Organizację Biologii Molekularnej (EMBO).
Mgr Adam Ustaszewski otrzymał stypendium międzynarodowe (Short-Term Fellowship) przyznane przez Europejską Organizację Biologii Molekularnej (EMBO).
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej (EMBO)
Mgr Adam Ustaszewski otrzymał stypendium międzynarodowe (Short-Term Fellowship) na projekt badawczy zatytułowany „Identification of putative alternations of open chromatin regions in Classical Hodgkin Lymphoma by integration of ATAC-Seq and high-throughput sequencing of cis-regulatory elements.”, przyznane przez Europejską Organizację Biologii Molekularnej (EMBO). Poznań. 24.01.2019 r.
Kto:
mgr inż. Ewelina Kowal-Wiśniewska
Nagroda I stopnia im. Prof. Jerzego Zwolińskiego w konkursie na najlepszą pracę magisterską wykonaną w roku akademickim 2017/2018 na Uniwersytecie Przyrodniczym w Poznaniu oraz złoty medal „Za osiągnięcia w studiach”.
Przyznał: Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu
Najlepsza praca magisterska wykonana w roku akademickim 2017/2018 oraz złoty medal "Za osiągnięcia w studiach".