Prowadzone przez nas badania koncentrują się wokół genetyki nowotworów oraz genetyki zmysłów. Wykorzystujemy szereg technik biologii molekularnej i cytogenetyki (mikromacierze, NGS, pirosekwencjonowanie, FISH, FICTION) uzupełnionych o analizy funkcjonalne. Celem dociekań jest identyfikacja uszkodzeń w obrębie genomu i epigenomu przyczyniających się do rozwoju chorób nowotworowych lub chorób narządów zmysłów. Badania prowadzimy w ścisłej współpracy z renomowanymi zespołami w kraju i za granicą.
Zakład Genetyki Nowotworów
Wybrane publikacje
The Narrow Band Imaging as an essential complement to White Light Endoscopy in Recurrent Respiratory Papillomatosis diagnostics and follow up process. Obrazowanie wąskopasmowe (NBI) – niezbędne uzupełnienie endoskopii światłem białym w diagnostyce i obserwacji nawracającej brodawczakowatości układu oddechowego.
Klimza H, Jackowska J, Pietruszewska W, Rzepakowska A, Wierzbicka M (artykuł dwujęzyczny)
Otolaryngol Pol, 2022, 76 (1): 1-5, Epub 2021 Oct 28, doi: doi: 10.5604/01.3001.0015.4540; doi: 10.5604/01.3001.0015.454MNiSW-100
The holmium:YAG laser lithotripsy - a non-invasive tool for removal of midsize stones of major salivary glands.
Kałużny J, Klimza H, Tokarski M, Piersiala K, Witkiewicz J, Katulska K, Wierzbicka M
Lasers Med Sci, 2022 Febr, 37 (1): 163-169, Epub 2020 Nov 21, doi: 10.1007/s10103-020-03201-0IF-3,161 MNiSW-70
Congenital amusia—pathology of musical disorder.
Szyfter K, Wigowska-Sowińska J
J Appl Genetics, 2022 Febr, 63 (1): 119-126, Epub 2021 Sept 21, doi: 10.1007/s13353-021-00662-zIF-3,240 MNiSW-100
Przyczyny wystąpienia choroby Meniere’a w świetle najnowszych danych literaturowych.
Dąbrowski P, Szyfter K
Post Chirurgii Głowy i Szyi, 2/2021, 20 (2), 17-21.MNiSW-20
New geneteic variants of TET2 and ASXL1 identified by next generation sequencing and pyrosequencing in a patient with MDS-RS-MLD and secondary acute myeloid leukemia.
Adamska MM, Kowal-Wiśniewska E, Kiwerska K, Ustaszewski A, Czerwińska-Rybak J, Kanduła Z, Wojtaszewska M, Barańska M, Pruchniewski Ł, Lewandowski K, Jarmuż-Szymczak M
Central Eur J Immunol, 2021, 46, 4: 1-6, 524-530. doi: 10.5114/ceji.2021.111166IF-2,085 MNiSW-70
Alginate and pectin films covering halloysite with encapsulated salicylic acid as food packaging components.
Kurczewska J, Ratajczak M, Gajecka M
IF-5,467 MNiSW-100
Alteration of the Early Development Environment by Maternal Diet and the Occurrence of Autistic-like Phenotypes in Rat Offspring.
Gawlińska K, Gawliński D, Kowal-Wiśniewska E, Jarmuż-Szymczak M, Filip M
Int J Mol Sci (MDPI), 2021, 22 (18): 9662;19 stron, https://doi.org/10.3390/ijms22189662IF-5,923 MNiSW-140
Genetics and Molecular Biology of Haad and Neck Cancer. Special Issue
Szyfter K
Biomolecules (MDPI), Special Issue on Genetics and Molecular Biology of Head and Neck Cancer, Szyfter K, guest editor, 10 articles, 2021, 11, 1293MNiSW-20
Changes in nuclear gene expression related to mitochondrial function affect extracellular matrix, collagens, and focal adhesion in Keratoconus.
Nowak-Malczewska D, Karolaak JA, Świerkowska J, Jaworska MM, Kulinska KI, Polakowski P, Rydzanicz M, Ploski R, Szaflik JP, Gajęcka M
Transl Vis Sci Technol, 2021 Sep 1;10 (11):6, 10 stron, doi: 10.1167/tvst.10.11.6IF-3,283 MNiSW-100
Prognostic roles of BRAF, KIT, NRAS, IGF2R and SF3B1 mutations in mucosal melanomas.
Wróblewska JP, Dias-Santagata D, Ustaszewski A, Wu ChL, Fujimoto M, Selim MA, Biernat W, Ryś J, Marszałek A, Hoand MP
Cells, 2021 Aug 27, 10 (9): 2216, 13 str, doi.10.3390/cells10092216IF-6,600 MNiSW-140
Pozostałe publikacje
Wybrane projekty badawcze
1. Projekt badawczy OPUS
„Całogenomowe poszukiwanie mutacji regulomu w płaskonabłonkowym raku krtani.”
Czas trwania: 2017-2020
2. Projekt badawczy PRELUDIUM
„Rola miR-299-5p w patogenezie płaskonabłonkowego raka krtani.”
Czas trwania: 2017-2020
3. Projekt badawczy OPUS
„Analiza ekspresji genów i białek potencjalnie zaangażowanych w tworzenie przerzutów do węzłów chłonnych w nowotworach krtani”
Czas trwania: 2016-2019
4. Projekt badawczy HARMONIA
„Identyfikacja miRNA zaangażowanych w patogenezę klasycznego chłoniaka Hodgkina przy pomocy zintegrowanej analizy ekspresji i mutacji oraz badań funkcjonalnych”
Czas trwania: 2015-2018
5. Narodowe Centrum Badań i Rozwoju - projekt finansowany w ramach Programu Operacyjnego Inteligentny Rozwój 2014-2020 działanie 4.1.4.
„Płynna biopsja – narzędzie do wykrywania <<odcisków raka>> we krwi obwodowej pacjentów z rakami głowy i szyi”.
Celem projektu jest opracowanie produktu: testu diagnostycznego i predykcyjnego, do wykrywania śladów materiału genetycznego raka we krwi obwodowej („CancerFingerprints) u pacjentów z rakami płaskonabłonkowymi głowy i szyi (HNSCC).
Efektem projektu będzie nowy produkt medyczny, nieznany dotąd na rynku polskim i rynkach zagranicznych.Opracowany produkt znajdzie szerokie zastosowanie w gospodarce jako narzędzie diagnostyczne i towarzyszące terapii HNSCC, ale także jako element rutynowych badań okresowych.
Dofinansowanie projektu z UE: 4 143 012,50 PLN
Projekt realizowany przez konsorcjum, w skład którego wchodzą:
Uniwersytet Medyczny w Poznaniu,
Szpital Kliniczny im. Heliodora Święcickiego Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu,
Instytut Genetyki Człowieka PAN,
Centrum Badań DNA Sp. z o.o
Współpraca krajowa i zagraniczna
Katedra Otolaryngologii Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Genetyki i Mikrobiologii Farmaceutycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Chemii Nieorganicznej i Analitycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Klinika Hematologii i Transplantacji Szpiku Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Institute of Human Genetics, Christian Albrecht’s University, Kiel, Germany
Division of Hematology, Oncology and Tumor Immunology, Medical Department, Charité, Berlin, Germany
Institute of Cell Biology (Tumor Research), University Duisburg-Essen, Germany
Senckenberg Institute of Pathology, Goethe University Frankfurt, Germany
Department of Otorhinolaryngology – Head and Neck Surgery, University of Turku, Finland
Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine Houston, TX, USA
Nagrody i wyróżnienia
Kto:
dr n. med. Julia Paczkowska
Dr Julia Paczkowska – została laureatką nagrody IX Edycji Konkursu Oddziału Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu
Przyznał: Oddział PAN w Poznaniu
za najlepszą publikację badawczą, która ukazała się w 2020 roku, a wiodącym autorem był doktorant.
Kto:
dr n. med. Joanna Świerkowska
Nomination for the Polish Intelligent Development Award 2020
Przyznał: Polish Intelligent Development
Nomination for the Polish Intelligent Development Award 2020 in the category: Sciencist of the future for the project: Rola metylacji DNA w etiologii wysokiej krótkowzroczności u polskich dzieci".
Kto:
dr hab. n. med. Maciej Giefing
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr n. med. Katarzyna Kiwerska
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
dr hab. n. med. Maciej Giefing
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr n. med. Katarzyna Kiwerska
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Nagroda Wydziału Nauk Medycznych PAN
Przyznał: Wydział Nauk Medycznych PAN
Za cykl 5 prac dotyczących utraty genów supresji nowotworowej w płaskonabłonkowym raku krtani.
Kto:
dr n. med. Joanna Świerkowska
Stypendium EMBO
Stypendium EMBO
Przyznał: Europejska Organizacji Biologii Molekularnej
Joanna Świerkowska z Zakładu Genetyki Nowotworów zdobyła stypendium Europejskiej Organizacji Biologii Molekularnej na realizacje projektu pt. „The role of the noncoding miRNA and enhancers in high myopia”. Badania w ramach grantu będą realizowane w Erasmus Medical Center, Holandia.
Kto:
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Stypendium
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej
Na realizację projekt pt “Platelets and platelet microparticles (PMP) as omnipresent RNA messengers in inflammatory diseases”.
Kto:
dr hab. n. med. Maciej Giefing
Powołanie na członka Rady Naukowej Instytutu Genetyki Człowieka PAN w Poznaniu na kadencję 2019-2022.
Przyznał: Rada Naukowa Instytutu Genetyki Człowieka PAN
Kto:
prof. dr hab. n. med. Marzena Gajęcka
Stypendium Fundacji Kościuszkowskiej
Przyznał: Fundacja Kościuszkowska
stypendium wyjazdowo-pobytowe z Fundacji Kościuszkowskiej, na rok akademicki 2019/2020, celem odbycia stażu naukowego w Baylor College of Medicine oraz Texas Children’s Hospital, w Houston, TX, w Stanach Zjednoczonych. Fundacja Kościuszkowska promuje polsko-amerykańską współpracę poprzez wymianę międzynarodową w dziedzinach edukacji, nauki oraz kultury. Fundacja Kościuszkowska przyznaje corocznie stypendia wyjazdowo-pobytowe oraz granty dla Polaków na studia, badania naukowe i/lub dydaktykę w uniwersytetach lub innych instytucjach realizujących kształcenie wyższe w Stanach Zjednoczonych.
Kto:
mgr Adam Ustaszewski
Mgr Adam Ustaszewski otrzymał stypendium międzynarodowe (Short-Term Fellowship) przyznane przez Europejską Organizację Biologii Molekularnej (EMBO).
Mgr Adam Ustaszewski otrzymał stypendium międzynarodowe (Short-Term Fellowship) przyznane przez Europejską Organizację Biologii Molekularnej (EMBO).
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej (EMBO)
Mgr Adam Ustaszewski otrzymał stypendium międzynarodowe (Short-Term Fellowship) na projekt badawczy zatytułowany „Identification of putative alternations of open chromatin regions in Classical Hodgkin Lymphoma by integration of ATAC-Seq and high-throughput sequencing of cis-regulatory elements.”, przyznane przez Europejską Organizację Biologii Molekularnej (EMBO). Poznań. 24.01.2019 r.
Kto:
mgr inż. Ewelina Kowal-Wiśniewska
Nagroda I stopnia im. Prof. Jerzego Zwolińskiego w konkursie na najlepszą pracę magisterską wykonaną w roku akademickim 2017/2018 na Uniwersytecie Przyrodniczym w Poznaniu oraz złoty medal „Za osiągnięcia w studiach”.
Przyznał: Uniwersytet Przyrodniczy w Poznaniu
Najlepsza praca magisterska wykonana w roku akademickim 2017/2018 oraz złoty medal "Za osiągnięcia w studiach".
Kto:
mgr Adam Ustaszewski
Wyróżnienie prezentacji
Przyznał: Komitet Organizacyjny 18th International Congress of Young Medical Scientists, Poznań, 14-16.06.2018 r. jako drugiej najlepszej w sesji Basic Life Sciences.
Ustaszewski A, Bednarek K, Wierzbicka M, Wojciechowicz J, Humińska K, Giefing M
Germline mutations in ALDH3A1 and RMDN2 genes as potential factors in salivary gland tumor development.