Pracownia Bioinformatyczna
dr n. med. Marcin Sajek
Publikacje
Nanopore sequencing of intact aminoacylated tRNAs.
White LK, Radakovic A, Sajek MP, Dobson K, Riemondy KA, del Pozo S, Szostak JW, Hesselberth JR.
Nature Communications, 2025, 16(1): 7781, 15 stron, doi: 10.1038/s41467-025-62545-9IF-15,7 MNiSW-200
Transcriptome-wide analysis of circRNA and RBP profiles and their molecular relevance for GBM.
Latowska-Łysiak J, Zarębska Ż, Sajek MP, Grabowska A, Buratin A, Głodowicz P, Misiorek JO, Kuczyński K, Bortoluzzi S , Żywicki M, Kosiński JG, Rybak-Wolf A , Piestrzeniewicz R , Barciszewska AM, Rolle K.
Molec Oncol, 2025 Aug;19 (8): 2270-2291. doi: 10.1002/1878-0261.70005.5, Epub 2025 Feb 26IF-4,5 MNiSW-140
Systematic analysis of nonsense variants uncovers peptide release rate as a novel modifier of nonsense-mediated mRNA decay.
Kolakada D, Fu R, Biziaev N, Shuvalov A, Lore M, Campbell AE, Cortázar MA, Sajek MP, Hesselberth JR, Mukherjee N, Alkalaeva E, Coban-Akdemir ZH, Jagannathan S.
Cell Genomics, 2025, 2025 May, 13:100882, 24 strony, doi: 10.1016/j.xgen.2025.100882IF-11,1 MNiSW-20
PDGFRα signaling regulates Srsf3 transcript binding to affect PI3K signaling and endosomal trafficking.
Forman TE, Sajek MP, Larson ED, Mukherjee N, Fantauzzo KA
eLife, 2024, 13: RP98531, doi: 10.7554/eLife.98531IF-6.4 MNiSW-200
Evolutionary dynamics of polyadenylation signals and their recognition strategies in protists.
Sajek MP, Bilodeau DY, Beer MA, Horton E, Miyamoto Y, Velle KB, Eckmann L, Fritz-Laylin L, Rissland OS and Mukherjee N
Genome Res. 2024 Oct 29;34 (10):1570-1581. doi: 10.1101/gr.279526.124, Epub Sep 26IF-6.2 MNiSW-200
Identification of ATM-dependent long non-coding RNAs induced in response to DNA damage.
Podralska M, Sajek MP, Bielicka A, Żurawek M, Ziółkowska-Suchanek I, Iżykowska K, Kolenda T, Kazimierska M, Kasprzyk ME, Sura W, Pietrucha B, Cukrowska B, Rozwadowska N, Dzikiewicz-Krawczyk A
DNA Repair (Amst), 2024, 135 March: 103648. doi: 10.1016/j.dnarep.2024.103648, Epub 2024 Feb 15IF-3,0 MNiSW-140
Small molecule inhibition of multiple RNA binding proteins by Ro-08-2750 underlies Musashi-2 independent phenotypes.
Walters K, Sajek MP, Murphy E, Issaian A, Baldwin A, Harrison E, Daniels M, Haines J, Hansen K, D’Alessandro A, Mukherjee N
RNA, 2023 Oct, 29 (10): 1458-70, doi: 10.1261/rna.079605.123 , Epub June 27IF-4.5 MNiSW-140
Emerging Roles of NANOS RNA-Binding Proteins in Cancer.
Ilaslan E, Sajek MP, Jaruzelska J, Kusz-Zamelczyk K
Int J Mol Sci (MDPI), 2022 Aug 20; 23 (16): 9408, 12 str,doi: 10.3390/ijms23169408.IF-6,208 MNiSW-140
Distinct Roles of NANOS1 and NANOS3 in the Cell Cycle and NANOS3‐PUM1‐FOXM1 Axis to Control G2/M Phase in A Human Primordial Germ Cell Model.
Ilaslan E, Kwiatkowska K, Śmialek MJ, Sajek MP, Lemańska Ż, Alla M, Janecki DM, Jaruzelska J, Kusz‐Zamelczyk K
Int J Molec Sci (MDPI), 2022, 23 (12): 6592, 19 str, https://doi.org/10.3390/ijms23126592IF-5,924 MNiSW-140
A new molecular mechanism of RNA circularization and the microRNA sponge formation.
Belter A, Popenda M, Sajek M, Woźniak T, Naskręt-Barciszewska MZ, Szachniuk M, Jurga S & Barciszewski J
J Biomolec Struct Dynamics, 2022, 40 (7):3038-3045, Epub 2020 Nov 17, doi: 10.1080/07391102.2020.1844802IF-3,39 MNiSW-70
Pozostałe publikacje
Nagrody i wyróżnienia
Kto:
prof. dr hab. n. biol. Jadwiga Jaruzelska
dr n. med. Marcin Sajek
dr n. med. Maciej Śmiałek
mgr Erkut Ilaslan
prof. dr hab. n. biol. Jadwiga Jaruzelska
dr n. med. Marcin Sajek
dr n. med. Maciej Śmiałek
mgr Erkut Ilaslan
Zespołowa Nagroda Wydziału Nauk Medycznych PAN
Przyznał: Wydział Nauk Medycznych PAN
Zespołowa Nagroda Wydziału V PAN za cykl 5 prac pt. „Rola białek NANOS oraz PUM w rozrodzie człowieka oraz niepłodności”.
Kto:
dr n. med. Marcin Sajek
dr n. med. Maciej Śmiałek
mgr Erkut Ilaslan
dr hab. n. med. Kamila Kusz-Zamelczyk
prof. dr hab. n. biol. Jadwiga Jaruzelska
mgr inż. Damian Janecki
dr n. med. Marcin Sajek
dr n. med. Maciej Śmiałek
mgr Erkut Ilaslan
dr hab. n. med. Kamila Kusz-Zamelczyk
prof. dr hab. n. biol. Jadwiga Jaruzelska
mgr inż. Damian Janecki
Publikacja Roku 2019
Przyznał: Dyrektor Instytutu Genetyki Człowieka PAN
Za za pracę oryginalną pt.: „PUM1 and PUM2 exhibit different modes of regulation for
SIAH1 that involve cooperativity with NANOS paralogues” opublikowaną w czasopiśmie Cellular and Molecular Life Sciences.
Kto:
dr n. med. Marcin Sajek
Stypendium na dwuletni pobyt podoktorski w ramach programu im. Bekkera Narodowej Agencji Wymiany Akademickiej.
Przyznał: NAWA
Stypendium na dwuletni pobyt podoktorski w ramach programu im. Bekkera Narodowej Agencji Wymiany Akademickiej. Pobyt badawczy będzie realizowany w University of Colorado, Denver, USA.
Kto:
dr hab. n. med. Kamila Kusz-Zamelczyk
prof. dr hab. n. biol. Jadwiga Jaruzelska
mgr Anna Spik
dr n. med. Marcin Sajek
dr hab. n. med. Kamila Kusz-Zamelczyk
prof. dr hab. n. biol. Jadwiga Jaruzelska
mgr Anna Spik
dr n. med. Marcin Sajek
Nagroda Polskiego Towarzystwa Genetycznego
Przyznał: Polskie Towarzystwo Genetyczne
Za najlepszą oryginalną pracę z zakresu genetyki człowieka wykonaną w polskich laboratoriach i opublikowaną w 2013 roku. Przyznana przez Polskie Towarzystwo Genetyczne autorom Kusz-Zamelczyk K, Sajek M, Spik A, Glazar R, Jedrzejczak P, Latos-Bielenska A, Kotecki M, Pawelczyk L, Jaruzelska J, nagrodzona praca: Mutations of NANOS1, a human homologue of the Drosophila morphogen, are associated with a lack of germ cells in testes or severe oligo-astheno-teratozoospermia. J Med Genet. (50, 187-93)