Samodzielna Grupa Badawcza Biologii RNA
Opis badań:
Regulacja ekspresji genów we wczesnych etapach rozwojowych ludzkich komórek płciowych, w kontekście niepłodności
Projekt ten koncentruje się na potranskrypcyjnych mechanizmach zaangażowanych we wczesnych etapach rozwoju komórek płciowych, w których uczestniczą białka oddziałujące z RNA, takie jak PUMILIO (PUM) oraz NANOS. Białka te wiążą się z regionem 3’ nieulegającym translacji (3’UTR) w specyficznych docelowych mRNA i determinują ich losy w kooperacji z maszynerią mikroRNA. Badania polegają na identyfikacji powstających na bazie tych białek rybonukleoproteinowych interaktomów. Analizujemy ich dynamikę, w trakcie powstawania oraz wczesnych etapów różnicowania pierwotnych komórek gametogenicznych człowieka. W szczególności interesują nas zmutowane warianty białek oddziałujących z RNA, zidentyfikowane u pacjentów cierpiących na niepłodność. Chcielibyśmy pokazać jakie potencjalne zmiany owe warianty powodują w interakcjach powyższych białek z RNA.
Oczekujemy że to podejście pozwoli nam wskazać szlaki kluczowe w podczas powstawania oraz wczesnych etapów różnicowania komórek płciowych oraz poznać molekularne przyczyny niepłodności człowieka. Modelem naszych badań jest linia ludzkich macierzystych komórek embrionalnych W15, które różnicujemy w kierunku komórek płciowych. Nasze badania prowadzimy w oparciu o wysokoprzepustowe techniki oraz szeroką gamę narzędzi bioinformatycznych.
Słowa kluczowe: potranskrypcyjna regulacja ekspresji genów, białka oddziałujące z RNA, mikroRNA, komórki płciowe
Identifikacja nowych genów zaangażowanych w proces determinacji płci człowieka
Badania mają na celu rzucenie światła na molekularne mechanizmy determinacji i różnicowania płci, by zrozumieć genetyczne podstawy nieprawidłowości rozwoju płciowego (DSD) człowieka. Na podstawie wysokoprzepustowych analiz genomu kilkudziesięciu pacjentow obarczonych DSD zidentyfikowaliśmy kilka genów kandydujących. Kontynuujemy badania by udowodnić ich rolę w procesach determinacji i różnicowania płci człowieka. Współpracujemy z polskimi ośrodkami sprawującymi opiekę nad pacjentami cierpiącymi na DSD (Uniwersytetem Medycznym w Poznaniu oraz Szpitalem-Pomnikiem Centrum Zdrowia Dziecka w Warszawie oraz z ośrodkami zagranicznymi (Uniwersytetem Genewskim, Uniwersytetem Medycznym w Erywaniu oraz Narodową Akademią Nauk Ukrainy w Kijowie).
Słowa kluczowe: determinacja płci człowieka, nieprawidłowości rozwoju płci (DSD)
