Prowadzone przez nas badania koncentrują się wokół genetyki nowotworów oraz genetyki zmysłów. Wykorzystujemy szereg technik biologii molekularnej i cytogenetyki (mikromacierze, NGS, pirosekwencjonowanie, FISH, FICTION) uzupełnionych o analizy funkcjonalne. Celem dociekań jest identyfikacja uszkodzeń w obrębie genomu i epigenomu przyczyniających się do rozwoju chorób nowotworowych lub chorób narządów zmysłów. Badania prowadzimy w ścisłej współpracy z renomowanymi zespołami w kraju i za granicą.
Zakład Genetyki Nowotworów
Wybrane publikacje
Blautia spp. in the gut microbiome: Its relation to dietary choices and to the nutritional status of patients with irritable bowel syndrome.
Pecyna P, Bykowska-Derda A, Gabryel M, Mankowska-Wierzbicka D, Nowak-Malczewska DM, Jaśkiewicz-Rajewicz K, Jaworska MM, Grzymisławski M, Dobrowolska A, Człapka-Matyasik M, Gajęcka M.
Nutrition, 2025 May 11;138:112836, doi: 10.1016/j.nut.2025.112836.IF-3,0 MNiSW-140
The Ready for Safe Cancer Treatment (RESET) tool: enhancing quality and optimizing timely and safe discharge with transitional care adjustments for Head and Neck Cancer patients
Wierzbicka M, Kiszka M, Banaś S, Jeziorny M, Zając B, Dwornikowska-Dabrowska M, Jędruchniewicz M,
Otolaryngol Pol, 2025 Mar 14;79 (3):1-7. doi: 10.5604/01.3001.0055.0006.IF-1,0 MNiSW-100
Newborns hearing screening – Polish experience. Narrative review.
Szyfter K, Gawęcki W, Szyfter W
J Clin Med, 2025 April, 14 (8): 2789, 10 str., 789. doi. 10.3390/jcm14082789
IF-3.0 MNiSW-140
Active piezoelectric bone conduction implant Osia ® 2 - evaluation of surgery and one-year audiological and quality of life benefits.
Gawęcki W, Gibasiewicz R, Błaszczyk M, Wierzbicka M, Bartkowiak E
Eur Arch Otorhinolaryngol, 2025M 282 (4): 1757-68, Epub 2024 Nov 9. doi: 10.1007/s00405-024-09057-2.
IF-1.9 MNiSW-70
Trends in Incidence and Mortality of Head and Neck Cancer Subsites Among Eldery Patients: A Population-Based Analysis.
Wierzbicka M, Pietruszewska W, Maciejczyk A, Markowski J
Cancers (MDPI), 2025 Feb 6; 17 (3): 548, 16 str. Doi: 103390/cancers17030548IF-4,5 MNiSW-140
HPV driven oncogenesis – much more than the E6 and E7 oncoproteins.
Janiszewska J, Kostrzewska-Poczekaj M, Wierzbicka M, Brenner JC, Giefing M
J Appl. Genetics, 2025 Feb (1), 66 (1): 63-71,doi.10.1007/s13353-024-00883-y, Epub 2024 June 24IF-2.0 MNiSW-140
A genome-wide scan of non-coding RNAs and enhancers for refractive error and myopia.
Tedja MS, Swierkowska-Janc J, Enthoven CA, Meester-Smoor MA, Hysi PG, Felix JF, Cowan CS; CREAM Consortium; Cherry TJ, van der Spek PJ, Ghanbari M, Erkeland SJ, Barakat TS, Klaver CCW, Verhoeven VJM
Hum Genet, 2025 Jan;144 (1):67-91. doi: 10.1007/s00439-024-02721-x. Epub 2025 Jan 8IF-3.8 MNiSW-100
Gender issues in myopia: a changing paradigm in generations.
Enthoven CA., Haarman A E G., Świerkowska-Janc J, Tideman JWL., Polling JR, Raat H, Verhoeven VJM, Labrecque J, Klaver CW
Eur J Epidemiol, 2024 Dec;39 (12):1315-1324. doi: 10.1007/s10654-024-01163-z. Epub 2024 Dec 11IF-7.7 MNiSW-140
Core regions in immunoglobulin heavy chain enhancers essential for survival of non-Hodgkin lymphoma cells are identified by a CRISPR interference screen.
Kasprzyk MA, Sura W, Podralska M, Kazimierska M, Seitz A, Łosiewski W, Woźniak T, Guikema JEJ, Diepstra A, Kluiver J, van den Berg A, Rozwadowska N, Dzikiewicz-Krawczyk A
Haematologica, 2024, 109, 12: 4007-4020; doi: 10.3324/haematol.2023.284672IF-8.2 MNiSW-140
FISH and FICTION in Lymphoma Research.
Giefing M, Sawicz G, Siebert R
In: Lymphoma. Methods and Protocols. Third Edition. Methods in Molecular Biology, vol. 2865, doi.10.1007/978-1-0716-4188-0_9, Humana Press, 2025, ISBN 978-1-0716-4187-3, ed.: Rafl Kuppers.pp-1-493.MNiSW-20
Pozostałe publikacje
Wybrane projekty badawcze
1. 10x Genomics Poland Grant Program
„Profilowanie przestrzenne transkryptomu w gruczolakach wielopostaciowych ślinianek o odmiennym przebiegu klinicznym”
Kierownik projektu: dr hab. Katarzyna Kiwerska
Okres realizacji: 2023-2024
2. Projekt badawczy PRELUDIUM – 21
„Metylom warstw i regionów topograficznych rogówki w stożku rogówki, badany z wykorzystaniem sekwencjonowania całego genomu”
Kierownik projektu: mgr Katarzyna Jaśkiewicz
Okres realizacji: 2023-2026
3. Projekt badawczy OPUS-21
„Uszkodzenia genu BCOR a aktywacja onkogennego szlaku CXCL12 w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2022-2025
4. Projekt badawczy OPUS – 21
„Dostępność chromatyny oraz warianty sekwencji w elementach regulatorowych w badaniach całogenomowych w patogenezie stożka rogówki”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marzena Gajęcka
Okres realizacji: 2022-2025
5. Projekt badawczy SONATA - 17
„Analiza metylomu cfDNA pacjentów z chłoniakiem Hodgkina”
Kierownik projektu: dr Kinga Bednarek
Okres realizacji: 2022-2025
6. Projekt badawczy OPUS-20
„Analiza funkcjonalna nowych, potencjalnie onkogennych miRNA w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2021-2024
7. Projekt badawczy PRELUDIUM - 19
„Mutacje elementów cis-regulatorowych jako potencjalny mechanizm prowadzący do niedostępności chromatyny i wyciszania genów w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: mgr Adam Ustaszewski
Okres realizacji: 2021-2024
8. Projekt badawczy OPUS – 16
„Wielopoziomowe badanie molekularne na podstawie laserowej mikrodysekcji rogówek w celu identyfikacji biomarkerów i celów terapeutycznych w stożku rogówki”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marzena Gajęcka
Okres realizacji: 2019-2024
9. Projekt ze środków Unii Europejskiej - Horyzont 2020
„On the road to excellence in unravelling the (epi)genetic landscape of hematologic neoplasms – NEXT_LEVEL”
Koordynator projektu ze strony IGC PAN: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2021-2023
10. Projekt badawczy PRELUDIUM - 18
„Rola metylacji DNA w etiologii wysokiej krótkowzroczności u polskich dzieci”
Kierownik projektu: dr Joanna Świerkowska
Okres realizacji: 2020-2023
Współpraca krajowa i zagraniczna
Katedra Otolaryngologii Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Genetyki i Mikrobiologii Farmaceutycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Chemii Nieorganicznej i Analitycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Klinika Hematologii i Transplantacji Szpiku Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Institute of Human Genetics, Christian Albrecht’s University, Kiel, Germany
Division of Hematology, Oncology and Tumor Immunology, Medical Department, Charité, Berlin, Germany
Institute of Cell Biology (Tumor Research), University Duisburg-Essen, Germany
Senckenberg Institute of Pathology, Goethe University Frankfurt, Germany
Department of Otorhinolaryngology – Head and Neck Surgery, University of Turku, Finland
Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine Houston, TX, USA
Nagrody i wyróżnienia
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Katarzyna Jaśkiewicz-Rajewicz
prof. dr hab. n. med. Marzena GajęckaII nagroda w konkursie na najlepszą publikację naukową z dziedziny diabetologii i chorób metabolicznych w 2023 r. im. Kazimierza Funka,
dr n. med. i n. o zdr. Katarzyna Jaśkiewicz-Rajewicz
prof. dr hab. n. med. Marzena Gajęcka
II nagroda w konkursie na najlepszą publikację naukową z dziedziny diabetologii i chorób metabolicznych w 2023 r. im. Kazimierza Funka,
Przyznał: Nagroda Polskiego Towarzystwa Diabetologicznego.
Polskie Towarzystwo Diabetologiczne doceniło pracę współautorstwa prof. Marzeny Gajęckiej i dr Katarzyny Jaśkiewicz (Gajecka M*, Gutaj P*, Jaskiewicz K*, Rydzanicz M, Szczapa T, Kaminska D, Kosewski G, Przyslawski J, Ploski R, Wender-Ozegowska E. Effects of maternal type 1 diabetes and confounding factors on neonatal microbiomes. Diabetologia. 2024 Feb;67(2):312-326. doi: 10.1007/s00125-023-06047-7 ; *autorzy równorzędni).
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Katarzyna Jaśkiewicz-Rajewicz
Nagroda główna
Przyznał: Oddział PAN w Poznaniu
na najlepszą oryginalną pracę twórczą doktoranta w 2023 r.: Jaskiewicz K, Maleszka-Kurpiel M, Kabza M, Karolak JA, Gajecka M. Sequence variants contributing to dysregulated inflammatory responses across keratoconic cone surface in adolescent patients with keratoconus. Front Immunol. 2023 Jul 6;14:1197054. doi: 10.3389/fimmu.2023.1197054.
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska-Janc
Stypendium na staż podoktorski
Przyznał: Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)
Stypendium „FY2024 JSPS Postdoctoral Fellowship for Research in Japan” na staż podoktorski w Department of Ophthalmology, Keio University, Tokio, Japonia. Tytuł projektu: „DNA methylation study in myopic mice towards explanation of increasing incidence of myopia worldwide”.
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska-Janc
Nagroda Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka
Nagroda Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka
Przyznał: Polskie Towarzystwo Genetyki Człowieka (PTGC)
Podczas XI Zjazdu Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka w Bydgoszczy, dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska otrzymała Nagrodę Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka – stopień doktora nadany w latach 2018-2020. Tytuł nagrodzonej pracy doktorskiej: „Charakterystyka wybranych aspektów (epi)–genetycznych w wysokiej krótkowzroczności u polskich pacjentów”.
Kto:
mgr inż. Ewelina Kowal-Wiśniewska
Nagroda im. prof. Aleksandra Szczygła za pracę naukowo-badawczą opublikowaną w roku 2021
Przyznał: Polskie Towarzystwo Nauk Żywieniowych
za pracę naukowo-badawczą opublikowaną w roku 2021 z zakresu nauki o żywieniu człowieka: Alteration of the Early Development Environment by Maternal Diet and the Occurrence of Autistic-like Phenotypes in Rat Offspring.
Kto:
dr n. med. Julia Paczkowska
Dr Julia Paczkowska – została laureatką nagrody IX Edycji Konkursu Oddziału Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu
Przyznał: Oddział PAN w Poznaniu
za najlepszą publikację badawczą, która ukazała się w 2020 roku, a wiodącym autorem był doktorant.
Kto:
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr hab. n. med. i n. o zdr. Katarzyna Kiwerska
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr hab. n. med. i n. o zdr. Katarzyna Kiwerska
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Nagroda Wydziału Nauk Medycznych PAN
Przyznał: Wydział Nauk Medycznych PAN
Za cykl 5 prac dotyczących utraty genów supresji nowotworowej w płaskonabłonkowym raku krtani.
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska-Janc
Stypendium EMBO Short-Term Fellowship
Stypendium EMBO Short-Term Fellowship
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej (EMBO)
Joanna Świerkowska z Zakładu Genetyki Nowotworów zdobyła stypendium Europejskiej Organizacji Biologii Molekularnej na realizacje projektu pt. „The role of the noncoding miRNA and enhancers in high myopia”. Badania w ramach grantu będą realizowane w Erasmus Medical Center, Holandia.
Kto:
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Stypendium
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej
Na realizację projekt pt “Platelets and platelet microparticles (PMP) as omnipresent RNA messengers in inflammatory diseases”.
Kto:
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
Powołanie na członka Rady Naukowej Instytutu Genetyki Człowieka PAN w Poznaniu na kadencję 2019-2022.
Przyznał: Rada Naukowa Instytutu Genetyki Człowieka PAN