Prowadzone przez nas badania koncentrują się wokół genetyki nowotworów oraz genetyki zmysłów. Wykorzystujemy szereg technik biologii molekularnej i cytogenetyki (mikromacierze, NGS, pirosekwencjonowanie, FISH, FICTION) uzupełnionych o analizy funkcjonalne. Celem dociekań jest identyfikacja uszkodzeń w obrębie genomu i epigenomu przyczyniających się do rozwoju chorób nowotworowych lub chorób narządów zmysłów. Badania prowadzimy w ścisłej współpracy z renomowanymi zespołami w kraju i za granicą.
Zakład Genetyki Nowotworów
Wybrane publikacje
Evidence against ZNF469 being causative for keratoconus in Polish patients.
Karolak JA, Gambin T, Rydzanicz M, Szaflik JP, Polakowski P, Frajdenberg A, Mrugacz M, Podfigurna-Musielak M, Stankiewicz P, Gajecka M; Acta Ophthalmol, 2016, 94 (3): 289-294.Proteomic profiling identifies the inorganic pyrophosphatase (PPA1) protein as a potential biomarker of metastasis in laryngeal squamous cell carcinoma.
Bodnar M, Łuczak M, Bednarek K, Szylberg Ł, Marszałek A, Grenmamn R, Szyfter K, Jarmuż-Szymczak M, Giefing M; Amino Acids, 2016, 48 (6): 1469-1476.Moving towards personalised therapy in head and neck squamous cell carcinoma through analysis of next generation sequencing data.
Giefing M, Wierzbicka M, Szyfter K, Brenner JC, Braakhuis BJ, Brakenhoff RH, Bradford CR, Sorensen JA, Rinaldo A, Rodrigo JP, Takes RP, Ferlito A; Eur J Cancer, 2016, 55: 147-157.Global miRNA Expression Profiling Identifies miR-1290 as Novel Potential oncomiR in Laryngeal Carcinoma.
Janiszewska J, Szaumkessel M, Kostrzewska-Poczekaj M, Bednarek K, Paczkowska J, Jackowska J, Grenman R, Szyfter K, Wierzbicka M, Giefing M, Jarmuz-Szymczak M; PLoS One, 2015, 10 (12): e0144924.Alterations of the CD58 gene in classical Hogkin lymphoma.
Schneider M, Schneider S, Zühlke-Jenisch R, Klapper W, Sundström Ch, Hartmann S, Hansmann M-L, Siebert R, Küppers R and Giefing M; Genes Chromosomes Cancer, 2015, 54 (10): 638-645.Nonrandom Distribution of miRNAs Genes and Single Nucleotide Variants in Keratoconus Loci.
Nowak DM, Gajecka M; PLoS One, 2015, 10 (7): e0132143.Diversified expression of aryl hydrocarbon receptor dependent genes in human laryngeal squamous cell carcinoma cell lines treated with ß-naphthoflavone
Brauze D, Fijalkiewicz K, Szaumkessel M, Kiwerska K, Bednarek K, Rydzanicz M, Richter J, Grenman R, Jarmuz-Szymczak M; Toxicol Lett, 2014, 231 (1): 99-107.The PRDX2 gene is transcriptionally silenced and de novo methylated in Hodgkin and Reed-Sternberg cells of classical Hodgkin lymphoma.
Schneider M, Szaumkessel M, Richter J, Ammerpohl O, Hansmann M-L, Küppers R, Siebert R and Giefing M; Blood, 2014, 123 (23): 3672-3673.Pozostałe publikacje
Wybrane projekty badawcze
1. Projekt badawczy OPUS
„Całogenomowe poszukiwanie mutacji regulomu w płaskonabłonkowym raku krtani.”
Czas trwania: 2017-2020
2. Projekt badawczy PRELUDIUM
„Rola miR-299-5p w patogenezie płaskonabłonkowego raka krtani.”
Czas trwania: 2017-2020
3. Projekt badawczy OPUS
„Analiza ekspresji genów i białek potencjalnie zaangażowanych w tworzenie przerzutów do węzłów chłonnych w nowotworach krtani”
Czas trwania: 2016-2019
4. Projekt badawczy HARMONIA
„Identyfikacja miRNA zaangażowanych w patogenezę klasycznego chłoniaka Hodgkina przy pomocy zintegrowanej analizy ekspresji i mutacji oraz badań funkcjonalnych”
Czas trwania: 2015-2018
5. Projekt badawczy HARMONIA
„Sekwencjonowanie egzomów polskich pacjentów ze sporadyczną postacią stożka rogówki oraz pilotażowe badanie profilu proteomicznego i metabolomicznego płynu łzowego pacjentów”
Czas trwania: 2014-2017
6. Projekt badawczy PRELUDIUM
„Wyciszanie i analiza funkcjonalna genu CDK1 w płaskonabłonkowym raku krtani”
Czas trwania: 2014-2017
7. Projekt badawczy PRELUDIUM
„Wyciszanie i analiza funkcjonalna wybranych genów potencjalnie zaangażowanych w patogenezę płaskonabłonkowych nowotworów krtani”
Czas trwania: 2014-2017
Współpraca krajowa i zagraniczna
Katedra Otolaryngologii Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Genetyki i Mikrobiologii Farmaceutycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Chemii Nieorganicznej i Analitycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Klinika Hematologii i Transplantacji Szpiku Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Institute of Human Genetics, Christian Albrecht’s University, Kiel, Germany
Division of Hematology, Oncology and Tumor Immunology, Medical Department, Charité, Berlin, Germany
Institute of Cell Biology (Tumor Research), University Duisburg-Essen, Germany
Senckenberg Institute of Pathology, Goethe University Frankfurt, Germany
Department of Otorhinolaryngology – Head and Neck Surgery, University of Turku, Finland
Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine Houston, TX, USA
Nagrody i wyróżnienia
Kto:
dr hab. n. med. Maciej Giefing
Ekspert Komisji Europejskiej powołany do oceny wniosków w ramach programu H2020-MSCA-IF-2016, Poznań, 2016
Przyznał: Komisja Europejska
Kto:
dr hab. n. med. Maciej Giefing
Powołanie na członka Rady Wydziału Lekarskiego I Uniwersytetu Medycznego im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu od roku 2016.
Przyznał: Rada Wydziału Lekarskiego I Uniwersytetu Medycznego im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu
Kto:
mgr Kinga Bednarek
prof. dr hab. n. med. Krzysztof Szyfter
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr hab. n. med. Maciej Giefing
mgr Kinga Bednarek
prof. dr hab. n. med. Krzysztof Szyfter
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr hab. n. med. Maciej Giefing
Wyróżnienie.
Przyznał: Komitet Organizacyjny 31st Int. Congress of the International Academy of Pathology, European Society of Pathology.
Wyróżnienie za plakat w sekcji Patologia Głowy i Szyi pt: The inorganic pyrophosphatase (PPA1) expression as the new potential metastatic parameter in laryngeal squamous cell carcinoma (LSCC). 31st International Congress of the International Academy of Pathology, European Society of Pathology w Kolonii (Niemcy), 25-29.09.2016 r.
Kto:
dr n. farm. Justyna Karolak
Nagroda Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka
Przyznał: Zarząd Główny Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka
Za najlepszą pracę doktorską z okresu 1.01.2014 do 30.06.2016 r.
Kto:
dr n. farm. Justyna Karolak
dr n. med. Dorota Nowak
Barbara Ginter-Matuszewska
prof. dr hab. n. med. Marzena Gajęcka
dr n. farm. Justyna Karolak
dr n. med. Dorota Nowak
Barbara Ginter-Matuszewska
prof. dr hab. n. med. Marzena Gajęcka
Brązowa Helisa
Przyznał: Komitet Organizacyjny V Polskiego Kongresu Genetyki
III nagroda za plakat: "Downregulation of core elements of TFG-b, Hippo, Wnt, and collagen synthesis pathways in keratoconus corneas, Łódź, 19-21.09.2016 r.
Kto:
dr n. farm. Justyna Karolak
Grant podróżny umożliwiający udział w European Human Genetics Conference 2015
Przyznał: Organizatorzy European Human Genetics Conference 2015
„Evidence against ZNF469 gene being the gene for keratoconus in general population”.
Kto:
mgr Julia Paczkowska
I miejsce w 51. Konkursie Prac Magisterskich Wydziału Farmaceutycznego
Przyznał: Wydział Farmaceutyczny Uniwersytetu Medycznego im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu
Za pracę magisterską pt. „Analiza metylacji wybranych genów w populacji kobiet ciężarnych z nadciśnieniem tętniczym”
Kto:
prof. dr hab. n. med. Krzysztof Szyfter
Golden Cross of Merit for scientific activity
Przyznał: President of Republic of Poland
For scientific activity
Kto:
mgr inż. Joanna Janiszewska
EMBO fellowship
Przyznał: EMBO
For a practical training at the King’s College
Kto:
dr n. farm. Justyna Karolak
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
dr n. farm. Justyna Karolak
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Stypendium
Przyznał: Wojewódzki Urząd Pracy w Poznaniu
W ramach projektu „Wsparcie stypendialne dla doktorantów na kierunkach uznanych za strategiczne z punktu widzenia rozwoju Wielkopolski”