Prowadzone przez nas badania koncentrują się wokół genetyki nowotworów oraz genetyki zmysłów. Wykorzystujemy szereg technik biologii molekularnej i cytogenetyki (mikromacierze, NGS, pirosekwencjonowanie, FISH, FICTION) uzupełnionych o analizy funkcjonalne. Celem dociekań jest identyfikacja uszkodzeń w obrębie genomu i epigenomu przyczyniających się do rozwoju chorób nowotworowych lub chorób narządów zmysłów. Badania prowadzimy w ścisłej współpracy z renomowanymi zespołami w kraju i za granicą.
Zakład Genetyki Nowotworów
Wybrane publikacje
Estimation of the Age of the Kashubian-Specific Pathogenic NPHS2 Variant Responsible for Hereditary Steroid-Resistant Nephrotic Syndrome Points to Its Recent Local Origin.
Jankowski M, Daca-Roszak P, Bałasz-Chmielewska J, Ustaszewski A, Żurowska A, Lipska-Ziętkiewiz BS, Ziętkiewicz E
Human Mutation, 2024, Article ID 8205102, 9 pages, https://doi.org/10.1155/2024/8205102IF-3.9 MNiSW-140
Differentially expressed microRNAs targeting genes in key pathways in keratoconus.
Nowak-Malczewska D, Świerkowska J, Gajęcka M
Front Genetics, 2024 Feb 26, 15, Manuscript ID: 1301676, doi 10.3389/fgene.2024.1301676IF-3.7 MNiSW-100
Defining the mutational profile of lower-risk myelodysplastic neoplasm patients with respect to disease progression using next-genetation sequencing and pyrosequencing.
Adamska M, Kowal-Wiśniewska E, Czerwińska-Rybak J, Kiwerska K, Barańska M, Gronowska W, Loba J, Brzeźnikiewicz-Janus K, Wasilewska E, Łanocha A, Jarmuż-Szymczak M, Gil L
Contempor Oncol, 2023, 27 (4): 269-276, doi: 10.5114/wo.2023.135365IF-1.8 MNiSW-70
Macrolide and Lincosamide Resistance of Streptococcus agalactiae in Pregnant Women in Poland.
Kamińska D, Ratajczak M, Nowak-Malczewska DM, Karolak JA , Kwaśniewski M, Szumala-Kąkol A, Długaszewska J, Gajęcka M
Scientific Reports, 2024 Feb 16;14 (1): 3877, 8 stron,. doi: 10.1038/s41598-024-54521-y.IF-4.6 MNiSW-140
Statistical Analysis of the Content of Metals in Blood Serum and in the Alternative Material in Head and Neck Carcinoma.
Herman M, Jakubowska M, Piekoszewski W, Woźniak A, Przybyłowicz A, Szukalska M, Golusińska-Kardach E, Gawęcki W, Czarnywojtek A, Walas A, Golusiński W, Ruchała M, Szyfter K, Ferlito A, Florek E
Arabian J Chemistry, 2024, 17 (3), art105577, 11 stron, doi: 10.1016/j.arabjc.2023.10557IF-6.0 MNiSW-70
Acute Myeloid Leukemia Post Cytotoxic Therapy in Breast Cancer Survivors—Over 23 Years of Single Center Analysis.
Adamska M, Kowal-Wiśniewska E, Barańska M, Przybyłowicz-Chalecka A, Łojko-Dankowska A, Joks M, Jarmuż-Szymczak M, Gil L
J Clin Med (MDPI), 2024, 13, 989, 17 str. doi. 10.3390/ jcm13040989IF-3.9 MNiSW-140
Rationale for Increasing Oncological Vigilance in Relation to Clinical Findings in Accessory Parotid Gland-Observations Based on 2192 Cases of the Polish Salivary Network Database.
Wierzbicka M, Bartkowiak E, Pietruszewska W, Stodulski D, Markowski J, Burduk P, Olejniczak I, Piernicka-Dybich A, Wierzchowska M, Amernik K, Chańko A, Majszyk D, Bruzgielewicz A, Gazinska P, Mikaszewski B
Cancers (Basel, MDPI). 2024 Jan 22;16 (2): 463, 13 str, doi: 10.3390/cancers16020463.IF-5.2 MNiSW-140
Towards effectiveness of cell free DNA based liquid biopsy in head and neck squamous cell-carcinoma.
Kowal-Wiśniewska E, Jaśkiewicz K, Bartochowska A, Kiwerska K, Ustaszewski A, Górecki T, Giefing M, Paluszczak J, Wierzbicka M, Jarmuż-Szymczak M
Scientific Reports, 2024 Jan 26;14 (1): 2251, 11 stron, doi: 10.1038/s41598-024-52031-5IF-4.6 MNiSW-140
Effects of maternal type 1 diabetes and confounding factors on neonatal microbiomes.
Gajęcka M, Gutaj P, Jaśkiewicz K, Rydzanicz M, Szczapa T, Kamińska D, Kosewski G, Przysławski J, Płoski R, Wender-Ożegowska E
Diabetologia, 2024 Feb, 67 (2): 312-326, doi: 10.1007/s00125-023-06047-7 Epub 2023 Nov 29.IF-8.2 MNiSW-140
Robot-assisted cochlear implantation via a modified pericanal approach (artykuł dwujęzyczny)
Gawęcki W, Balcerowiak A, Podlawska P, Szyfter W, Wierzbicka M
Otolaryngol Pol, 2023; 77 (6): 18-23; doi: 10.5604/01.3001.0016.3414 doi: 10.5604/01.3001.0053.4090IF-0.6 MNiSW-140
Pozostałe publikacje
Wybrane projekty badawcze
1. 10x Genomics Poland Grant Program
„Profilowanie przestrzenne transkryptomu w gruczolakach wielopostaciowych ślinianek o odmiennym przebiegu klinicznym”
Kierownik projektu: dr hab. Katarzyna Kiwerska
Okres realizacji: 2023-2024
2. Projekt badawczy PRELUDIUM – 21
„Metylom warstw i regionów topograficznych rogówki w stożku rogówki, badany z wykorzystaniem sekwencjonowania całego genomu”
Kierownik projektu: mgr Katarzyna Jaśkiewicz
Okres realizacji: 2023-2026
3. Projekt badawczy OPUS-21
„Uszkodzenia genu BCOR a aktywacja onkogennego szlaku CXCL12 w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2022-2025
4. Projekt badawczy OPUS – 21
„Dostępność chromatyny oraz warianty sekwencji w elementach regulatorowych w badaniach całogenomowych w patogenezie stożka rogówki”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marzena Gajęcka
Okres realizacji: 2022-2025
5. Projekt badawczy SONATA - 17
„Analiza metylomu cfDNA pacjentów z chłoniakiem Hodgkina”
Kierownik projektu: dr Kinga Bednarek
Okres realizacji: 2022-2025
6. Projekt badawczy OPUS-20
„Analiza funkcjonalna nowych, potencjalnie onkogennych miRNA w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2021-2024
7. Projekt badawczy PRELUDIUM - 19
„Mutacje elementów cis-regulatorowych jako potencjalny mechanizm prowadzący do niedostępności chromatyny i wyciszania genów w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: mgr Adam Ustaszewski
Okres realizacji: 2021-2024
8. Projekt badawczy OPUS – 16
„Wielopoziomowe badanie molekularne na podstawie laserowej mikrodysekcji rogówek w celu identyfikacji biomarkerów i celów terapeutycznych w stożku rogówki”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marzena Gajęcka
Okres realizacji: 2019-2024
9. Projekt ze środków Unii Europejskiej - Horyzont 2020
„On the road to excellence in unravelling the (epi)genetic landscape of hematologic neoplasms – NEXT_LEVEL”
Koordynator projektu ze strony IGC PAN: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2021-2023
10. Projekt badawczy PRELUDIUM - 18
„Rola metylacji DNA w etiologii wysokiej krótkowzroczności u polskich dzieci”
Kierownik projektu: dr Joanna Świerkowska
Okres realizacji: 2020-2023
Współpraca krajowa i zagraniczna
Katedra Otolaryngologii Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Genetyki i Mikrobiologii Farmaceutycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Chemii Nieorganicznej i Analitycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Klinika Hematologii i Transplantacji Szpiku Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Institute of Human Genetics, Christian Albrecht’s University, Kiel, Germany
Division of Hematology, Oncology and Tumor Immunology, Medical Department, Charité, Berlin, Germany
Institute of Cell Biology (Tumor Research), University Duisburg-Essen, Germany
Senckenberg Institute of Pathology, Goethe University Frankfurt, Germany
Department of Otorhinolaryngology – Head and Neck Surgery, University of Turku, Finland
Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine Houston, TX, USA
Nagrody i wyróżnienia
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska
Stypendium na staż podoktorski
Przyznał: Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)
Stypendium „FY2024 JSPS Postdoctoral Fellowship for Research in Japan” na staż podoktorski w Department of Ophthalmology, Keio University, Tokio, Japonia. Tytuł projektu: „DNA methylation study in myopic mice towards explanation of increasing incidence of myopia worldwide”.
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska
Nagroda Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka
Nagroda Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka
Przyznał: Polskie Towarzystwo Genetyki Człowieka (PTGC)
Podczas XI Zjazdu Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka w Bydgoszczy, dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska otrzymała Nagrodę Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka – stopień doktora nadany w latach 2018-2020. Tytuł nagrodzonej pracy doktorskiej: „Charakterystyka wybranych aspektów (epi)–genetycznych w wysokiej krótkowzroczności u polskich pacjentów”.
Kto:
mgr inż. Ewelina Kowal-Wiśniewska
Nagroda im. prof. Aleksandra Szczygła za pracę naukowo-badawczą opublikowaną w roku 2021
Przyznał: Polskie Towarzystwo Nauk Żywieniowych
za pracę naukowo-badawczą opublikowaną w roku 2021 z zakresu nauki o żywieniu człowieka: Alteration of the Early Development Environment by Maternal Diet and the Occurrence of Autistic-like Phenotypes in Rat Offspring.
Kto:
dr n. med. Julia Paczkowska
Dr Julia Paczkowska – została laureatką nagrody IX Edycji Konkursu Oddziału Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu
Przyznał: Oddział PAN w Poznaniu
za najlepszą publikację badawczą, która ukazała się w 2020 roku, a wiodącym autorem był doktorant.
Kto:
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr hab. n. med. i n. o zdr. Katarzyna Kiwerska
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr hab. n. med. i n. o zdr. Katarzyna Kiwerska
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Nagroda Wydziału Nauk Medycznych PAN
Przyznał: Wydział Nauk Medycznych PAN
Za cykl 5 prac dotyczących utraty genów supresji nowotworowej w płaskonabłonkowym raku krtani.
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska
Stypendium EMBO Short-Term Fellowship
Stypendium EMBO Short-Term Fellowship
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej (EMBO)
Joanna Świerkowska z Zakładu Genetyki Nowotworów zdobyła stypendium Europejskiej Organizacji Biologii Molekularnej na realizacje projektu pt. „The role of the noncoding miRNA and enhancers in high myopia”. Badania w ramach grantu będą realizowane w Erasmus Medical Center, Holandia.
Kto:
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Stypendium
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej
Na realizację projekt pt “Platelets and platelet microparticles (PMP) as omnipresent RNA messengers in inflammatory diseases”.
Kto:
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
Powołanie na członka Rady Naukowej Instytutu Genetyki Człowieka PAN w Poznaniu na kadencję 2019-2022.
Przyznał: Rada Naukowa Instytutu Genetyki Człowieka PAN
Kto:
prof. dr hab. n. med. Marzena Gajęcka
Stypendium Fundacji Kościuszkowskiej
Przyznał: Fundacja Kościuszkowska
stypendium wyjazdowo-pobytowe z Fundacji Kościuszkowskiej, na rok akademicki 2019/2020, celem odbycia stażu naukowego w Baylor College of Medicine oraz Texas Children’s Hospital, w Houston, TX, w Stanach Zjednoczonych. Fundacja Kościuszkowska promuje polsko-amerykańską współpracę poprzez wymianę międzynarodową w dziedzinach edukacji, nauki oraz kultury. Fundacja Kościuszkowska przyznaje corocznie stypendia wyjazdowo-pobytowe oraz granty dla Polaków na studia, badania naukowe i/lub dydaktykę w uniwersytetach lub innych instytucjach realizujących kształcenie wyższe w Stanach Zjednoczonych.
Kto:
mgr Adam Ustaszewski
Mgr Adam Ustaszewski otrzymał stypendium międzynarodowe (Short-Term Fellowship) przyznane przez Europejską Organizację Biologii Molekularnej (EMBO).
Mgr Adam Ustaszewski otrzymał stypendium międzynarodowe (Short-Term Fellowship) przyznane przez Europejską Organizację Biologii Molekularnej (EMBO).
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej (EMBO)
Mgr Adam Ustaszewski otrzymał stypendium międzynarodowe (Short-Term Fellowship) na projekt badawczy zatytułowany „Identification of putative alternations of open chromatin regions in Classical Hodgkin Lymphoma by integration of ATAC-Seq and high-throughput sequencing of cis-regulatory elements.”, przyznane przez Europejską Organizację Biologii Molekularnej (EMBO). Poznań. 24.01.2019 r.