Prowadzone przez nas badania koncentrują się wokół genetyki nowotworów oraz genetyki zmysłów. Wykorzystujemy szereg technik biologii molekularnej i cytogenetyki (mikromacierze, NGS, pirosekwencjonowanie, FISH, FICTION) uzupełnionych o analizy funkcjonalne. Celem dociekań jest identyfikacja uszkodzeń w obrębie genomu i epigenomu przyczyniających się do rozwoju chorób nowotworowych lub chorób narządów zmysłów. Badania prowadzimy w ścisłej współpracy z renomowanymi zespołami w kraju i za granicą.
Zakład Genetyki Nowotworów
Wybrane publikacje
Gender issues in myopia: a changing paradigm in generations.
Enthoven CA., Haarman A E G., Świerkowska-Janc J, Tideman JWL., Polling JR, Raat H, Verhoeven VJM, Labrecque J, Klaver CW
Eur J Epidemiol, 2024 Dec;39 (12):1315-1324. doi: 10.1007/s10654-024-01163-z. Epub 2024 Dec 11IF-7.7 MNiSW-140
Core regions in immunoglobulin heavy chain enhancers essential for survival of non-Hodgkin lymphoma cells are identified by a CRISPR interference screen.
Kasprzyk MA, Sura W, Podralska M, Kazimierska M, Seitz A, Łosiewski W, Woźniak T, Guikema JEJ, Diepstra A, Kluiver J, van den Berg A, Rozwadowska N, Dzikiewicz-Krawczyk A
Haematologica, 2024, 109, 12: 4007-4020; doi: 10.3324/haematol.2023.284672IF-8.2 MNiSW-140
FISH and FICTION in Lymphoma Research.
Giefing M, Sawicz G, Siebert R
In: Lymphoma. Methods and Protocols. Third Edition. Methods in Molecular Biology, vol. 2865, doi.10.1007/978-1-0716-4188-0_9, Humana Press, 2025, ISBN 978-1-0716-4187-3, ed.: Rafl Kuppers.pp-1-493.MNiSW-20
A rapid parallel increase in the incidence and mortality of head and neck cancer among the Polish elderly over the last two decades and upward trends until 2035.
Markowski J, Pietruszewska W, Mikaszewski B, Jurkiewicz D, Rogowski M, Maciejczyk A, Niemczyk K, Klatka J, Wierzbicka M
Otolaryngol Pol. 2024 Dec 11; 78 (6):39-47. doi: 10.5604/01.3001.0054.8131IF-1.0 MNiSW-100
Long read sequencing identifies complex structural variant landscape and recurrent TERT rearrangements in mucoepidermoid carcinoma.
Gensterblum-Miller E, Bhangale A, Majid D Al, Pienkowski VM, Rydzanicz M, Janiszewska J, Kostrzewska-Poczekaj M, Chang C, Brummel C, Michmerhuizen NL,Wang J, Sandford E, Tewari M, Wierzbicka M, Birkeland AC, McHugh JB, Spector ME, Giefing M, Jarmuz-Szymczak M, Heft Neal ME, Brenner JC
Oral Oncology, 2024, Volume 159, doi: 10.1016/j.oraloncology.2024.107108IF-4.0 MNiSW-140
Diagnostyka różnicowa brodawkowatego guza języka u 71-letniego pacjenta ostatecznie zdiagnozowanego jako rak płaskonabłonkowy brodawkowaty języka.
Frączkowska A, Brust K., Dmowska K, Wierzbicka M
MNiSW-20
TYK2 protein expression and its potential as the tissue-based biomarker for the diagnosis of colorectal cancer.
Zadka Ł, Ustaszewski A, Glatzel-Plucińska N, Rusak A,, Łaczmańska I, Ratajczak-Wielgomas K, Kmiecik A, Piotrowska A, Haczkiewicz-Leśniak K, Gomułkiewicz A, Kostrzewska-Poczekaj M, Dzięgiel P
Cancers (MDPI) 2024 Oct 30, 16 (21(: 3665, 23 str., doi.org/10.3390/cancers16213665IF-4.5 MNiSW-140
Role of Exosomes in Salivary Gland Tumors and Technological Advances in Their Assessment.
Nieszporek A, Wierzbicka M, Labedz N, Zajac W, Cybinska J, Gazinska P
Cancers (Base, MDPI). 2024 Sep 27;16 (19): 3298, 20 str., doi: 10.3390/cancers16193298.IF-4.5 MNiSW-140
The Clinical and Surgical Characteristics of Parotid Tumors with Parapharyngeal Space Involvement-A Multicenter Experience of the Polish Salivary Network.
Stodulski D, Mikaszewski B, Witkowski P, Bartkowiak E, Pietruszewska W, Olejniczak I, Markowski J, Piernicka-Dybich A, Burduk P, Wierzchowska M, Czech J, Radomska K, Chańko A, Majszyk D, Bruzgielewicz A, Gazińska P, Wierzbicka M
IF-3.0 MNiSW-140
The usefulness of narrow-band Imaging (NBI) in nasopharyngeal lesions-Validation of the Ni NBI classification dedicated for vascular pattern in the nasopharynx.
Klimza H, Maćkowiak B, Zagaja K, Jackowska J, Banaszewski J, Wierzbicka M
PLoS One. 2024 Jun 17; 19 (6):e0302043. doi: 10.1371/journal.pone.0302043. eCollection 2024IF-2.9 MNiSW-100
Pozostałe publikacje
Wybrane projekty badawcze
1. 10x Genomics Poland Grant Program
„Profilowanie przestrzenne transkryptomu w gruczolakach wielopostaciowych ślinianek o odmiennym przebiegu klinicznym”
Kierownik projektu: dr hab. Katarzyna Kiwerska
Okres realizacji: 2023-2024
2. Projekt badawczy PRELUDIUM – 21
„Metylom warstw i regionów topograficznych rogówki w stożku rogówki, badany z wykorzystaniem sekwencjonowania całego genomu”
Kierownik projektu: mgr Katarzyna Jaśkiewicz
Okres realizacji: 2023-2026
3. Projekt badawczy OPUS-21
„Uszkodzenia genu BCOR a aktywacja onkogennego szlaku CXCL12 w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2022-2025
4. Projekt badawczy OPUS – 21
„Dostępność chromatyny oraz warianty sekwencji w elementach regulatorowych w badaniach całogenomowych w patogenezie stożka rogówki”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marzena Gajęcka
Okres realizacji: 2022-2025
5. Projekt badawczy SONATA - 17
„Analiza metylomu cfDNA pacjentów z chłoniakiem Hodgkina”
Kierownik projektu: dr Kinga Bednarek
Okres realizacji: 2022-2025
6. Projekt badawczy OPUS-20
„Analiza funkcjonalna nowych, potencjalnie onkogennych miRNA w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2021-2024
7. Projekt badawczy PRELUDIUM - 19
„Mutacje elementów cis-regulatorowych jako potencjalny mechanizm prowadzący do niedostępności chromatyny i wyciszania genów w klasycznym chłoniaku Hodgkina”
Kierownik projektu: mgr Adam Ustaszewski
Okres realizacji: 2021-2024
8. Projekt badawczy OPUS – 16
„Wielopoziomowe badanie molekularne na podstawie laserowej mikrodysekcji rogówek w celu identyfikacji biomarkerów i celów terapeutycznych w stożku rogówki”
Kierownik projektu: prof. dr hab. Marzena Gajęcka
Okres realizacji: 2019-2024
9. Projekt ze środków Unii Europejskiej - Horyzont 2020
„On the road to excellence in unravelling the (epi)genetic landscape of hematologic neoplasms – NEXT_LEVEL”
Koordynator projektu ze strony IGC PAN: prof. dr hab. Maciej Giefing
Okres realizacji: 2021-2023
10. Projekt badawczy PRELUDIUM - 18
„Rola metylacji DNA w etiologii wysokiej krótkowzroczności u polskich dzieci”
Kierownik projektu: dr Joanna Świerkowska
Okres realizacji: 2020-2023
Współpraca krajowa i zagraniczna
Katedra Otolaryngologii Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Genetyki i Mikrobiologii Farmaceutycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Zakład Chemii Nieorganicznej i Analitycznej Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Katedra i Klinika Hematologii i Transplantacji Szpiku Uniwersytetu Medycznego w Poznaniu
Institute of Human Genetics, Christian Albrecht’s University, Kiel, Germany
Division of Hematology, Oncology and Tumor Immunology, Medical Department, Charité, Berlin, Germany
Institute of Cell Biology (Tumor Research), University Duisburg-Essen, Germany
Senckenberg Institute of Pathology, Goethe University Frankfurt, Germany
Department of Otorhinolaryngology – Head and Neck Surgery, University of Turku, Finland
Department of Molecular and Human Genetics, Baylor College of Medicine Houston, TX, USA
Nagrody i wyróżnienia
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Katarzyna Jaśkiewicz-Rajewicz
prof. dr hab. n. med. Marzena GajęckaII nagroda w konkursie na najlepszą publikację naukową z dziedziny diabetologii i chorób metabolicznych w 2023 r. im. Kazimierza Funka,
dr n. med. i n. o zdr. Katarzyna Jaśkiewicz-Rajewicz
prof. dr hab. n. med. Marzena Gajęcka
II nagroda w konkursie na najlepszą publikację naukową z dziedziny diabetologii i chorób metabolicznych w 2023 r. im. Kazimierza Funka,
Przyznał: Nagroda Polskiego Towarzystwa Diabetologicznego.
Polskie Towarzystwo Diabetologiczne doceniło pracę współautorstwa prof. Marzeny Gajęckiej i dr Katarzyny Jaśkiewicz (Gajecka M*, Gutaj P*, Jaskiewicz K*, Rydzanicz M, Szczapa T, Kaminska D, Kosewski G, Przyslawski J, Ploski R, Wender-Ozegowska E. Effects of maternal type 1 diabetes and confounding factors on neonatal microbiomes. Diabetologia. 2024 Feb;67(2):312-326. doi: 10.1007/s00125-023-06047-7 ; *autorzy równorzędni).
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Katarzyna Jaśkiewicz-Rajewicz
Nagroda główna
Przyznał: Oddział PAN w Poznaniu
na najlepszą oryginalną pracę twórczą doktoranta w 2023 r.: Jaskiewicz K, Maleszka-Kurpiel M, Kabza M, Karolak JA, Gajecka M. Sequence variants contributing to dysregulated inflammatory responses across keratoconic cone surface in adolescent patients with keratoconus. Front Immunol. 2023 Jul 6;14:1197054. doi: 10.3389/fimmu.2023.1197054.
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska-Janc
Stypendium na staż podoktorski
Przyznał: Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)
Stypendium „FY2024 JSPS Postdoctoral Fellowship for Research in Japan” na staż podoktorski w Department of Ophthalmology, Keio University, Tokio, Japonia. Tytuł projektu: „DNA methylation study in myopic mice towards explanation of increasing incidence of myopia worldwide”.
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska-Janc
Nagroda Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka
Nagroda Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka
Przyznał: Polskie Towarzystwo Genetyki Człowieka (PTGC)
Podczas XI Zjazdu Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka w Bydgoszczy, dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska otrzymała Nagrodę Polskiego Towarzystwa Genetyki Człowieka za najlepszą pracę doktorską z zakresu genetyki człowieka – stopień doktora nadany w latach 2018-2020. Tytuł nagrodzonej pracy doktorskiej: „Charakterystyka wybranych aspektów (epi)–genetycznych w wysokiej krótkowzroczności u polskich pacjentów”.
Kto:
mgr inż. Ewelina Kowal-Wiśniewska
Nagroda im. prof. Aleksandra Szczygła za pracę naukowo-badawczą opublikowaną w roku 2021
Przyznał: Polskie Towarzystwo Nauk Żywieniowych
za pracę naukowo-badawczą opublikowaną w roku 2021 z zakresu nauki o żywieniu człowieka: Alteration of the Early Development Environment by Maternal Diet and the Occurrence of Autistic-like Phenotypes in Rat Offspring.
Kto:
dr n. med. Julia Paczkowska
Dr Julia Paczkowska – została laureatką nagrody IX Edycji Konkursu Oddziału Polskiej Akademii Nauk w Poznaniu
Przyznał: Oddział PAN w Poznaniu
za najlepszą publikację badawczą, która ukazała się w 2020 roku, a wiodącym autorem był doktorant.
Kto:
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr hab. n. med. i n. o zdr. Katarzyna Kiwerska
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
dr hab. n. med. Małgorzata Jarmuż-Szymczak
dr hab. n. med. i n. o zdr. Katarzyna Kiwerska
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Nagroda Wydziału Nauk Medycznych PAN
Przyznał: Wydział Nauk Medycznych PAN
Za cykl 5 prac dotyczących utraty genów supresji nowotworowej w płaskonabłonkowym raku krtani.
Kto:
dr n. med. i n. o zdr. Joanna Świerkowska-Janc
Stypendium EMBO Short-Term Fellowship
Stypendium EMBO Short-Term Fellowship
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej (EMBO)
Joanna Świerkowska z Zakładu Genetyki Nowotworów zdobyła stypendium Europejskiej Organizacji Biologii Molekularnej na realizacje projektu pt. „The role of the noncoding miRNA and enhancers in high myopia”. Badania w ramach grantu będą realizowane w Erasmus Medical Center, Holandia.
Kto:
dr n. med. Magdalena Kostrzewska-Poczekaj
Stypendium
Przyznał: Europejska Organizacja Biologii Molekularnej
Na realizację projekt pt “Platelets and platelet microparticles (PMP) as omnipresent RNA messengers in inflammatory diseases”.
Kto:
prof. dr hab. n. med. i n. o zdr. Maciej Giefing
Powołanie na członka Rady Naukowej Instytutu Genetyki Człowieka PAN w Poznaniu na kadencję 2019-2022.
Przyznał: Rada Naukowa Instytutu Genetyki Człowieka PAN