Zakład Patologii Molekularnej skupia się na badaniach molekularnych podstaw chorób człowieka ze szczególnym uwzględnieniem chorób cywilizacyjnych takich jak nowotwory i chorób układu krążenia. Jesteśmy zaangażowani w opracowywanie innowacyjnych terapii komórkowych w tym opartych na technologii CAR-T. Dysponujemy szerokim portfolio technik pozwalających na funkcjonalną charakterystykę niekodujących sekwencji genomu w procesach komórkowych i patogenezie nowotworów. Wykorzystujemy komórki pluripotentne (iPSC) do tworzenia modeli tkanek o wysokim stopniu zaawansowania, takich jak Engineered Heart Tissue (EHT), wykorzystywanych do badania zależności między kardiomiocytami a fibroblastami w sercu oraz opracowywania nowych podejść terapeutycznych. Prowadzimy badania na modelach komórkowych zarówno w hodowlach tradycyjnych jak i 3D. Nasze badania przedkliniczne opierają się głównie na wykorzystaniu immunokompromisowanych modeli zwierzęcych umożliwiających ocenę proponowanych podjeść terapeutycznych w układzie ksenogenicznym.

W ramach Zakładu funkcjonują dwie samodzielne grupy badawcze:

SGB Funkcji Niekodujących Części Genomu prowadzona przez prof. IGC PAN dr hab. Agnieszkę Dzikiewicz Krawczyk.

SGB Zaawansowanych Modeli Tkankowych prowadzona przez prof. IGC PAN dr hab. Tomasza Kolanowskiego.

Słowa kluczowe:

Wybrane publikacje

Non-coding RNAs: Mechanisms of action. Chapter 3.

Kasprzyk M, Kazimierska M, Sura W, Dzikiewicz-Krawczyk A, Podralska M

Navigating Non-coding RNA from Biogenesis to Therapeutic Application, 2023, Academic Press, Elsevier, ed: Sztuba-Solińska J; ISBN978-0-323-90406-3

MNiSW-80

Wybrane projekty badawcze

1. Projekt badawczy NCN MINIATURA 1

ncn

“Global analysis of microRNA in CD4+ T lymphocytes of patients with autoimmune polyglandular syndrome”

Kierownik projektu: dr hab. Magdalena Żurawek

Okres realizacji:

2. Projekt badawczy NCN SONATA 11

ncn

„Efekt wyłączenia genu FAM13A w komórkach raka płuc”

Kierownik projektu: dr hab. Iwona Ziółkowska-Suchanek

Okres realizacji: 2017-2021

 

3. Projekt badawczy NCN SONATA 12

ncn

„Identyfikacja funkcjonalnych miejsc wiązania MYC oraz docelowych genów niezbędnych dla wzrostu komórek nowotworowych w oparciu o badanie przesiewowe CRISPR/Cas9”

Kierownik projektu: dr hab. Agnieszka Dzikiewicz-Krawczyk

Okres realizacji:2017-2021

 

4. Projekt badawczy NCN OPUS 13

ncn

„Modelowanie spermatogenezy człowieka dla potrzeb badania, diagnozy i terapii męskiej niepłodności”

Kierownik projektu: dr hab. Natalia Rozwadowska

Okres realizacji: 2018-2023

 

5. Projekt badawczy NCN OPUS 14

ncn

„Identyfikacja i funkcjonalna charakterystyka długich niekodujących RNA zaangażowanych w zależną od ATM odpowiedź na uszkodzenia DNA”

Kierownik projektu: dr hab. Agnieszka Dzikiewicz-Krawczyk

Okres realizacji: 2018-2023

6. Projekt badawczy NCN OPUS 14

ncn

„Poznanie funkcji genu kodującego transbłonowe białko TMEM244 i jego roli w rozwoju nowotworów limfoidalnych”

Kierownik projektu: prof. Grzegorz Przybylski

Okres realizacji: 2018-2021

 

7. Projekt badawczy NCN SONATA 13

ncn

„Maskowane substraty bioluminogenne do selektywnego obrazowania parametrów biochemicznych raka”

Konsorcjum IChB PAN/IGC PN

Kierownik projektu: dr Jacek Kolanowski

Kierownik prac badawczo-rozwojowych IGC PAN: dr hab. Natalia Rozwadowska

Okres realizacji: 2018 – 2023

 

8. Projekt badawczy NCN SONATA 13

ncn

„FIBROdrive – definicja roli fibroblastów w różnicowaniu tkanki serca. Ocena mechanizmu wpływu komorowo-specyficznych fibroblastów na specjalizację kardiomiocytów z wykorzystaniem inżynierii tkankowej w modelu serca człowieka”

Kierownik projektu: dr hab. Tomasz Kolanowski

Okres realizacji: 2019-2024

 

 

9. Narodowe Centrum Badań i Rozwoju: Pierwszy polsko-chiński konkurs bilateralny

 

„Podwójny efekt supresji genu BCL11B w celowanej terapii nowotworów z komórek T”

Kierownik projektu: prof. Grzegorz Przybylski (IGC PAN)

Kierownik projektu: Yangqiu Li (Jinan University, Guangzhou, China)

Okres realizacji : 2019-2022

10. Projekt badawczy FIRST TEAM FNP

„Funkcjonalna analiza regionu regulatorowego genu IGH w chłoniakach nieziarniczych z komórek B”

Kierownik projektu: dr hab. Agnieszka Dzikiewicz-Krawczyk

Okres realizacji: 2019-2023

11. Projekt badawczy NCN PRELUDIUM BIS

ncn

“Badanie genów regulowanych przez białko z rodziny RBM będącego elementem uczestniczącym w splicingu podczas spermatogenezy u człowieka”

Kierownik projektu: dr hab. Natalia Rozwadowska

Okres realizacji: 2020-2023

12. Projekt badawczy NCN SONATA 15

ncn

„Znaczenie deacetylaz histonowych klasy II: HDAC9 i HDAC10 w Zespole Sezary’ego”

Kierownik projektu: dr Katarzyna Iżykowska

Okres realizacji: 2020–2024

 

13. Projekt badawczy NCN OPUS 24

ncn

„Bo do tanga trzeba dwojga – modelowanie kardiomiopatii w zespole Marfana z zastosowaniem komórek serca oraz konstruktów tkankowych (EHT) uzyskanych z hiPSC”

Kierownik projektu: dr hab. Natalia Rozwadowska

Okres realizacji: 2023-2027

14. Projekt badawczy NCN OPUS 25

ncn

„Przeciwnowotworowy potencjał porfiryny TMPyP4 w fotodynamicznej terapii raka piersi oraz ocena bezpieczeństwa zastosowania”

Konsorcjum UMP/IGC PAN

Kierownik UMP: Prof. Błażej Rubiś (UMP)

Kierownik prac badawczo-rozwojowych IGC PAN: dr hab. Natalia Rozwadowska

Okres realizacji:

15. Projekt badawczy NCN OPUS 25

ncn

„Funkcjonalne następstwa utraty chromosomu Y (LOY) w komórkach układu immunologicznego w kontekście chorób nowotworowych – badania ex-vivo oraz in vitro z wykorzystaniem komórek ludzkich.”
Konsorcjum GUM/IGC PAN

Kierownik GUM: Prof. Jan Dumański

Kierownik prac badawczo-rozwojowych IGCz: dr hab. Natalia Rozwadowska

Okres realizacji:

 

16. Projekt badawczy NCN PRELUDIUM 22

ncn

„Przezwyciężanie stanu wyczerpania komórek CAR-T poprzez modyfikację enhancerów przy użyciu technologii CRISPR”

Kierownik projektu: dr Karolina Rassek

Okres realizacji: 2024–2027

17. Grant wyjazdowy STSM

Grant wyjazdowy STSM (Short-Term Scientific Missions) w ramach projektu COST Action CorEuStem (CA20140)

Beneficjent: mgr Agnieszka Nadel

Okres realizacji:

18. MEiN DOKTORATY WDROŻENIOWE

Okres realizacji: 2019-2023

  1. „Opracowanie produktu leczniczego terapii zaawansowanej opartego na WJ-MSC w leczeniu stwardnienia zanikowego bocznego (ALS)”
  2. „Opracowanie opatrunku biologicznego do zastosowania w leczeniu zmian skórnych u pacjentów z Epidermolysis Bullosa (EB)”

Kierownik prac badawczo-rozwojowych IGCz: dr hab. Natalia Rozwadowska

Okres realizacji: 2022-2025

  1. „Terapia CAR-T w nowotworach litych – nowe strategie terapii celowanej w mikrośrodowisko guza”
  2. „AlloCAR – allogeniczne produkty CAR-T w terapii nowotworów hematologicznych

Kierownik prac badawczo-rozwojowych IGCz: dr hab. Natalia Rozwadowska; dr hab. Tomasz Kolanowski

Współpraca krajowa i zagraniczna

Katedra i Klinika Dermatologii, Wenerologii i Alergologii Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego

Katedra i Klinika Dermatologii Uniwersytetu Medycznego im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu

I Klinika Kardiologii- Uniwersytecki Szpital Kliniczny w Poznaniu

Ghent University (UGent), Belgium – Faculty of Medicine and Health Sciences – Department of Human Structure and Repair

Centrum Medyczne Kształcenia Podyplomowego- Zakład Fizjologii Klinicznej, Warszawa, Polska

Międzynarodowa Agenda Badawcza, Laboratorium Medycyny 3P, Gdański Uniwersytet Medyczny

Katedra i Klinika Endokrynologii, Przemiany Materii i Chorób Wewnętrznych, Uniwersytet Medyczny im. K. Marcinkowskiego w Poznaniu

Katedra i Klinika Pediatrii, Diabetologii i Endokrynologii, Gdański Uniwersytet Medyczny

Klinika Diabetologii i Otyłości Wieku Rozwojowego, Uniwersytet Medyczny im. K. Marcinkowskiego w Poznaniu

Wielkopolskie Centrum Zaawansowanych Technologii, Uniwersytet im. Adama Mickiewicza w Poznaniu

Laboratorium Genomiki i Bioinformatyki, Instytut Genetyki Molekularnej Czeskiej Akademii Nauk

Klinika Reumatologii, Rehabilitacji i Chorób Wewnętrznych, Uniwersytet Medyczny im. Karola Marcinkowskiego w Poznaniu

Oddział Torakochirurgii, Wielkopolskie Centrum Pulmonologii i Torakochirurgii im. Eugenii i Janusza Zeylandów

University Medical Center Groningen, Holandia

University Medical Center Amsterdam, Holandia

Clinic for Internal Medicine C, University Greifswald, Greifswald, Germany

Key Laboratory for Regenerative Medicine of Ministry of Education, Institute of Hematology, School of Medicine, Jinan University, Guangzhou 510632, Chiny

Institute of Pharmacology & Toxicology, TU Dresden, Germany

BIOSENSE INSTITUTE – RESEARCH AND DEVELOPMENT INS, Serbia

UNIVERSITAT DE BARCELONA, Hiszpania

VRIJE UNIVERSITEIT BRUSSEL, Belgia

Nagrody i wyróżnienia

Kto: mgr Marta Kasprzyk
Nagroda im. prof. Włodzimierza Krzyżosiaka
Przyznał: Komitet Biologii Molekularnej PAN

Praca zatytułowana „Adar-mediated A-to-I editing is required for embryonic patterning and innate immune response regulation in zebrafish” Katarzyna Niescierowicz, Leszek Pryszcz, Cristina Navarrete, Eugeniusz Tralle, Agata Sulej, Karim Abu Nahia, Marta Elżbieta Kasprzyk, Katarzyna Misztal, Abhishek Pateria, Adrianna Pakuła, Matthias Bochtler & Cecilia Winata, otrzymała wyróżnienie im. prof. Włodzimierza Krzyżosiaka za najlepszą pracę doświadczalną w zakresie badań nad kwasami nukleinowymi wykonaną w polskim laboratorium opublikowaną w 2022 r.

Kto: dr n. med. i n. o zdr. Karolina Rassek
Stypendium Naukowe Miasta Poznania dla młodych badaczy z poznańskiego środowiska naukowego za wyróżniający się dorobek naukowy w zakresie badania molekularnych mechanizmów leżących u podstaw chłoniaków skórnych T-komórkowych.

Przyznał: Stypendium Naukowe Miasta Poznania

Stypendia naukowe Miasta Poznania przyznawane są wyróżniającym się badaczom, wykazującym się sukcesami w swojej dziedzinie nauki.

Kto: dr n. med. i n. o zdr. Karolina Rassek
Wyróżnienie w konkursie organizowanym przez Oddział PAN w Poznaniu na najlepszą oryginalną pracę doktoranta w 2022 r.
Przyznał: Oddział PAN w Poznaniu

Wyróżniona publikacja: Rassek K., Iżykowska K., Żurawek M, Nowicka K., Joks M., Olek-Hrab K., Olszewska B., Sokołowska- Wojdyło M., Biernat W., Nowicki R.J., G.K. Przybylski, TMEM244 Gene Expression as a Potential Blood Diagnostic Marker Distinguishing Sézary Syndrome from Mycosis Fungoides and Benign Erythroderma, J Invest Dermatol. 2022 Sep 8;S0022-202X(22)01899-1.doi: 10.1016/j.jid.2022.08.046.

Kto: mgr Monika Pieniawska
Nagroda im. Prof. Kazimierza Ostrowskiego
Przyznał: Komitet organizacyjny XIV Ogólnopolskiej Konferencji "Postępy w Badaniach Biomedycznych", Warszawa 4.03.3023 r.

wystąpienie ustne pt. Wpływ nadekspresji histonowej 10 na biologię komórek nowotworowych w Zespole Sezary'ego.

Kto: mgr Monika Pieniawska
Wyróżnienie pracy w sesji prac eksperymentalnych - Forum Młodych Polskiego Towarzystwa Dermatologicznego.
Przyznał: Polskie Towarzystwo Dermatologiczne

Wyróżnienie pracy w sesji prac eksperymentalnych pt.: Znaczenie nadekspresji deacytelazy histonowej klasy II HDAC10 w Zespole Sezary’ego. Forum Młodych Polskiego Towarzystwa Dermatologicznego. Łódź, 20-21.10.2022 r. (Pieniawska M, Rassek K, Skwara B, Zurawek M, Ziółkowska-Suchanek I, Podralska M, Nowicka K, Rozwadowska N, Iżykowska K)

Kto: mgr Marta Kasprzyk
W ramach nagrody Marta została wybrana do zaprezentowania swojego plakatu w formie krótkiego wykładu
Przyznał: 4th International Conference on the Long and the Short of Non-Coding RNAs

W ramach nagrody Marta została wybrana do zaprezentowania swojego plakatu w formie krótkiego wykładu:
“Functional dissection of IGH enhancers and enhancer RNAs in B-cell lymphomas”
Współautorzy pracy: Marta Kasprzyk, Weronika Sura, Wojciech Łosiewski, Marta Podralska, Marta Kazimierska, Tomasz Woźniak, Natalia Rozwadowska, Agnieszka Dzikiewicz-Krawczyk

Kto: mgr Marta Kasprzyk
Helisa 2022
Przyznał: Polskie Towarzystwo Genetyki Człowieka, VI Polski Kongres Genetyki, Kraków, 27-30.06.2022 r.

za najlepsze plakaty zaprezentowane na sesji Genetyki Człowieka: Marta Kasprzyk, Weronika Sura, Wojciech Łosiewski, Marta Podralska, Marta Kazimierska, Tomasz Woźniak, Natalia Rozwadowska, Agnieszka Dzikiewicz-Krawczyk - Functional dissection of IGH enhancers and enhancer RNAs in B-cell lymphomas.

Kto: dr hab. n. med. i n. o zdr. Iwona Ziółkowska-Suchanek
"Aegean Conference Travel Award"
Przyznał: 7th International Conference on tumor Microenvironment and Cellular Stress: Signaling, Metabolism, Imaging and Therapeutic Targets.

wykład pt. “Hypoxia-induced FAM13A modulates lung cancer cells growth, metastatic potential and actin cytoskeleton organization”. Konferencja: 7th International Conference on Tumor Microenvironment and Cellular Stress: Signaling, Metabolism, Imaging and Therapeutic Targets. Kos, Grecja, 18-25.09.2021 r.

Kto: dr n. med. Marta Kazimierska
Stypendium
Przyznał: Dyrektor IChB PAN

Stypendium na rok akademicki 2020/21

Kto: prof. dr hab. n. med. Grzegorz Przybylski
Polska Nagroda Inteligentnego Rozwoju 2020 w kategorii: Naukowiec przyszłości
Przyznał: Centrum Inteligentnego Rozwoju

Polska Nagroda Inteligentnego Rozwoju 2020 w kategorii: Naukowiec przyszłości za realizację projektów pt. „Podwójny efekt supresji genu BCL11B w celowanej terapii nowotworów komórek T”, „Poznanie funkcji genu kodującego transbłonowe białko TMEM244 i jego roli w rozwoju nowotworów limfoidalnych” oraz „Gen BCL11B – Potencjalny Cel Terapeutyczny w Nowotworach z Komórek T”.