27 kwietnia zespół Samodzielnej Grupy Badawczej Regionalnym Centrum Medycyny Cyfrowej Instytutu Genetyki Człowieka PAN w Poznaniu uczestniczył w wizycie merytoryczno-szkoleniowej w Regionalnym Centrum Medycyny Cyfrowej przy Pomorskim Uniwersytecie Medycznym w Szczecinie. Spotkanie odbyło się na zaproszenie dr. n. med. Thierry’ego van de Weteringa. W spotkaniu ze strony SGB RCMC IGC PAN uczestniczyli dr hab. Ewa Strauss, mgr Natalia Łopacińska, mgr Wojciech Włoszek.
W trakcie wizyty przedstawiciele naszego instytutu zapoznali się z funkcjonowaniem Biobanku RCMC PUM oraz infrastruktury sekwencjonowania, obejmującej wysokoprzepustową platformę Illumina NovaSeq X oraz system długich odczytów PromethION 2i. Omówiono organizację procesów biobankowania, standardy jakości oraz rozwiązania informatyczne, ze szczególnym uwzględnieniem identyfikowalności próbek i wymagań audytowych.
Istotnym elementem wizyty było porównanie rozwiązań infrastrukturalnych oraz wskazanie zastosowań systemu BioBank Management System, którego konsultantem i współtwórcą jest dr van de Wetering. Synergia ośrodków RCMC wynika ze zbliżonego wyposażenia infrastrukturalnego, w szczególności w zakresie platformy nanoporowej PromethION 2i.
Wizyta była powiązana z organizowaną przez PUM konferencją Nanopore Day, poświęconą zastosowaniom sekwencjonowania nanoporowego. Zespół SGB RCMC wdraża tę technikę do analiz całogenomowych (WGS) oraz badań mikrobioty.
Spotkanie umożliwiło identyfikację dobrych praktyk oraz określenie kierunków dalszej współpracy w obszarze biobankowania i sekwencjonowania genomowego.
